農業綜合開發貫徹落實中央關於“三農”工作的決策部署，堅持以建設高標準農田為載體，以推進農業產業化為抓手，以發展農業社會化服務為支撐，加大對新型農業經營主體的支持力度。
一是通過產業化發展項目示範引領。2016年，中央財政投入農業綜合開發資金60億元，支援6000多個新型農業經營主體開展產業化發展專案建設，實施一批區域特色明顯、示範帶動作用強的種植養殖基地、農產品加工、流通服務設施專案。二是通過土地治理專案夯實基礎。開展新型農業經營主體直接申報承建高標準農田專案試點，2016年，中央財政共投入農業綜合開發資金5.6億元，
支援308家新型農業經營主體建設高標準農田77.4萬畝，構建項目建設、使用、管護一體化的新機制。實施創新投融資機制加快建設高標準農田試點，對新型農業經營主體給予財政貼息和補助支持，共實施試點專案31個，撬動銀行貸款10.8億元，預計建設高標準農田110.7萬畝。三是通過農業社會化服務專案提供服務支撐。2017年，中央財政安排農業綜合開發供銷合作總社部門專案資金3.35億元，
其中扶持116個新型農業經營主體服務能力提升和產業融合發展；中央財政安排資金3.18億元，扶持121個基層供銷合作社開展土地託管服務，為新型農業經營主體提供全託管和半託管服務。