圓環病毒感染後， 發病豬只表現出多種臨床症狀， 主要有以下幾種：仔豬斷奶後多系統衰竭綜合征（PMWS）：主要是2～4月齡的豬發病，
豬皮炎與腎炎綜合征（PDNS）：該病通常發生在保育和生長期的豬， 成年豬散發。 3月齡及以上的豬發病後病死率達100%， 而1.5月齡和3月齡的病死率為50%。 急性病例在臨床出現症狀後幾天內死亡。 皮膚發生圓形或不規則形的隆起， 呈現紅色或紫色中央為黑色的丘疹， 丘疹常融合成帶狀或斑塊狀， 隨後發展成黑色結痂。 病灶通常在後軀、後肢和腹部， 有時也擴展到胸肋和耳。 發病較輕的豬體溫正常、行為無異、常可在7～10天不治而愈。
PCV－Ⅱ相關性繁殖障礙：PCV－Ⅱ目前也被認為是引起繁殖障礙的病因， 臨床症狀主要是：流產、死產、木乃伊胎增多、斷奶前死亡率升高。 圓環病毒在臨床上還可能引起其他症狀， 如水樣腹瀉、進行性咳嗽和中樞神經系統障礙。 此外， 約有20%的病例出現貧血、黃疸， 大多數病例為慢性， 或難於察覺。
圓環病毒感染可引起豬的免疫抑制， 是引起豬場混合感染的重要因素， 是豬場管理防治的重點。 因此， 各類豬場必須加強管理措施以改善或降低發病率。 具體措施如下：
（1）貫徹全進全出制 各批斷奶後， 徹底將分娩舍和污水溝洗淨和消毒；充分洗淨母豬的身體， 分娩前進行驅蟲；確需寄養的仔豬必須從分娩開始24 小時內進行；每一群頭數控制在13 頭以下， 各個豬欄之間要用木板或水泥磚牆（不是用柵欄）隔開；嚴格全進全出， 排空污水溝， 洗淨， 消毒；減少飼養密度（3 頭/立方）；每頭豬的採食間隔增加7釐米；淨化空氣；改善溫度管理；不再編組。
（2）加強管理 保育/育肥舍， 減少每群的頭數， 豬欄之間用水泥磚牆隔開；斷奶後不再重新編群；出售後返回的豬需單獨飼養， 不得混群；降低飼養密度；提高仔豬舍溫度；改善空氣和濕度管理。 強化各方面的衛生（切齒， 斷尾， 注射等）；對發病的豬及早隔離或淘汰。
（3）提高日糧水準通過提高斷奶仔豬的日糧營養濃度、添加功能性多糖、維生素和電解質等以提高豬只非特異性免疫力。
（4）免疫接種 接種豬圓環病毒疫苗， 同時制定免疫接種程式， 盡可能減少疫苗接種數量， 調整疫苗接種時間， 以便降低豬的應激和最大程度發揮免疫功能。