三芝區位於中國臺灣省新北市最北端， 背山面海、風景旖旎， 是一個自然景觀豐富的美麗小鎮。 在這裡的淺水灣， 人們可以觀海聽濤、踏浪雕沙， 自清代以來， 該地就開始有人定居， 叫做"芝蘭三堡"。 1920年， 日本殖民者設立三芝莊， 二戰後成為臺北縣轄鄉。 2010年， 臺北縣改名為新北市， 提格成省直轄市， 於是稱為三芝區。
上世紀70年代末， 一個雄心勃勃的開發商相中三芝區， 不惜重金購下岸邊土地， 打算建造一個富人度假村。 按照計畫， 度假村裡的十幾幢房屋全是飛碟造型， 遊人不僅能夠欣賞“面朝大海”的美景， 還能享受居住在“飛碟”裡的生活。 1981年， 飛碟屋正式開始動工興建， 計畫兩年內全部竣工。 建造初期， 開發商在靠近公路出口處， 修建了一座雄偉的城門樓， 門前盤繞著一條氣勢磅礴的水泥巨龍。
不料隨著公路擴寬， “巨龍”必須拆除， 因過於沉重無法移動， 只好被截斷。
對於飛碟屋地下有上萬具屍骨的說法， 三芝區官方後來表示確有其事。 三芝曾是一個古戰場， 以前荷蘭人與西班牙人都攻打過臺灣， 甚至荷、西兩國為爭奪臺灣還兵鋒相向。 明朝官兵也曾駐紮過三芝， 也爆發過好幾場戰爭， 因此出現這些骨骸並不意外， 但民間卻添油加醋地講述各種鬧鬼的故事。 隨著時間流逝， 這些飛碟屋經過日曬雨淋、海風吹襲， 變得殘破不堪， 增添了幾分陰森感， 成為了“鬼屋”。
一開始， 廢棄的飛碟屋成了吸毒者和遊民的樂園， 但由於潮濕， 不少遊民感到骨頭酸痛， 還患上了風濕病， 也漸漸了搬離了這些面朝大海的“別墅”。
不過， 年久失修的飛碟屋存在重大安全隱患。 2008年， 臺北縣政府決定拆除飛碟屋。 得知此消息後， 大量攝影愛好者以及普通市民聯名呼籲， 希望至少能保留一幢飛碟屋來做紀念。 但他們的籲請並沒能如願， 最終這些充滿神秘氛圍的建築被夷為平地。