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基因資訊查詢網址,一個就夠

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乾貨 | 靠譜 | 實用

如果我們要瞭解一個基因的基本資訊要去看什麼呢?如果要看基因的序列, 我們可以去NCBI, UCSC和ENsembl, 如果要看這個基因的蛋白功能, 那可以去uniprot, 那麼有沒有一個網站把這些其他好的網站的資訊匯總到一起的呢?這個答案吧, 還真的有, 那就是我們要介紹的網站:

GeneCards(http://www.genecards.org/)

我們先看一下這個網站的介紹吧:

看到沒有, 這個網站自動的總結了125其他網站的資訊, 怎麼樣是不是感覺很厲害, 那麼接下來我們來看一下這個神奇的網站吧。 在搜索基因進入主介面以後, 我們可以在頁面的頂端看到這樣子的資訊,

這個是網站基本資訊的小標題, 仔細看一下是不是很詳細?那下面我們就看一下這些自己的內容吧

我們以p21基因為例看一下這個網站的一些常用的基本資訊吧(由於資訊太多, 沒提到的可以自己的挖掘一下):

1. 對於一個基因會有很多, 我們查的可能使基因的曾用名, 所以GENECADR中就要一項是aliases.如下圖P21是CDKN1A的曾用名。

2.我們查一個基因時常常會看NCBI或UNIPROT上對這個基因的描述這樣會讓我們快速的瞭解這個基因, 在genecard中, 則把其他網站中的描述都放到了一起, 不用我們去其他網站看這些資訊了, 如圖

3.看完對此基因的描述後, 我們可以在”function’中觀察基因的功能, genecard中不僅總結了此基因基本的功能, 還包括對於基因GO分析的功能和其基因的臨床疾病表型, 如圖:p21的功能介紹和Go分析

4.看完對於基因GO分析的描述, 我們可以在”Pathway“中觀察其可能涉及的通路及PPI。 如下圖:P21涉及的信號通路及PPI;其中標記:R的為reactome的通路資訊(很生動的一個通路網站, 有時間再介紹吧), G為kegg的資訊

5.在”location”中, 我們可以觀察基因的定位。 如下圖:p21的基因定位

6.在”expression“中可以觀察基因在不同組織的表達情況

GeneCard的基因功能就介紹到這裡, 至於其他的, 比如看基因的剪接變異體呀, 相關的文章呀, 藥物作用呀大家有需要的可以自己去看, 都是很明瞭的資訊。

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