食用菌培養料是影響食用菌生長發展的很重要的一部分， 那怎樣才能製作一種非常好的培養料呢？
備料：按培養料重量的0.1%（即千分之一， 如報廢料重新利用， 可按0.2%添加）備好食用菌培養料發酵助劑；將粉碎或切斷的主料預先浸泡或沖淋預濕， 將水分調至60—70%， PH值8左右。
混料：用新鮮米糠（陳舊米糠營養較差， 不利）將發酵助劑稀釋（每1公斤發酵助劑加5公斤米糠）， 再將稀釋好的發酵助劑， 與提前預濕的麩皮、餅肥、糞肥等其他輔料混合均勻， 然後再均勻混入主料中。
制堆：將培養料原料攪拌均勻， 按常規堆制， 堆內用直徑10釐米左右的尖頭棒均勻打孔通氣，
翻倒：當物料溫度升至65℃左右， 可進行第一次翻倒， 3—4天再次翻倒， 雙孢菇料堆翻倒間隔略長。
控溫：發酵初期溫度可能迅速升至70-75℃以上屬於正常， 但應立即翻倒， 不能長期保持75℃以上的高溫， 否則會造成培養料養分較大損耗， 影響產量。 後期根據不同食用菌種類對溫度的不同要求， 分別採取撤去覆蓋物、增加打孔密度、補水、降低堆高、翻倒等措施將溫度控制在適當的範圍內。
調濕：伴隨著料堆溫度的急劇升高和熱量的不斷積聚， 物料中的水分會大量蒸發散失， 故翻倒的同時， 還應視具體情況及時補水（補0.5%生石灰水為佳）， 最後一次補水與翻堆應同時完成，
完成：平菇、草菇等菌類培養料約需發酵5-6天左右；雙孢菇需10-15天左右。 發酵腐熟好的培養料， 水分65%左右， 一般呈咖啡色， 表面佈滿白色菌絲， 無氨味有芳香氣味， 不粘手且富有彈性， 稻草秸稈輕拉即斷， 表明發酵完成。