2016年9月， 舟山市順利通過財政部和國家海洋局的評審答辯， 獲批成為國家“十三五”首批海洋經濟創新發展示範城市。 浙江舟山群島新區作為浙江海洋經濟發展先導區、海洋綜合開發試驗區和長江三角洲地區經濟發展重要增長極， 經國務院批准， 相繼設立了中國舟山江海聯運服務中心和自由貿易港區。
舟山海洋經濟創新發展示範城市建設工作主要圍繞海洋生物和海洋高端裝備兩大產業， 實施產業鏈協同創新和產業孵化集聚創新， 主要在國家遠洋漁業基地、海洋產業集聚區、普陀臨港產業園區、海洋科學城等四個區塊開展專案示範工作。
通過重點專案的實施示範， 相關產業鏈的延伸， 公共技術服務平臺的搭建和海洋新興產業技術的研發孵化， 帶動社會資本在海洋經濟領域的投入， 培育一批海洋經濟創新型龍頭骨幹企業、中小型科技企業，
浙江海力生集團有限公司把新型生物醫藥科技融合到傳統海洋產業， 實現海洋資源的“全利用、零浪費”。
浙江興業集團有限公司通過複合酶解抽提技術、酶工程技術、美拉德反應技術， 開發了海鮮提取液和蛋白粉等產品， 實現水產副產物及低值資源的綜合化和高值化利用。
浙江同博科技發展有限公司， 擁有北斗導航民用服務資質， 建有16米的衛星地面站、大資料處理和監控中心等與北斗民用相配套的基礎平臺設施， 並已開發出多項基於北斗定位等綜合運營應用的系統及其配套產品。
浙江嘉藍海洋電子有限公司設有浙江省海洋及船舶電子研究院和楊小牛院士工作站， 完成了多款無人艇成熟產品的研製：11.5米無人艇、7.5米艦載有人/無人雙模式艇、15米雙體無人艇（國家科技部專案）等。
舟山岱山縣秀山南部海域的“LHD林東模組化大型海洋潮流能發電關鍵技術與裝備”專案已通過中國海洋工程諮詢協會組織的科技成果鑒定， 項目科技成果達到國際領先水準， 這是目前世界上唯一一台實現全天候穩定發電並網的潮流能發電項目。
國電舟山海上風電項目(普陀6號)已於2016年在舟山六橫島動工開建， 總投資46.7億元， 這是浙江省首個海上風電場項目。