1、大師鄰居有個老婆婆， 每日念佛數千， 大師問她為什麼， 她回答說：“我死去的丈夫持佛名號， 臨終無病， 與人拱手作揖就走了， 故而知道念佛功德不可思議。 ”大師聽後， 從此歸心於淨土， 自書“生死事大”四個字， 貼在案角床頭。 且家中戒殺生， 祭祀祖先都用素食。
2、明朝嘉慶乙丑年除夕那天， 大師讓湯氏沏茶， 茶杯剛放進茶盤裡就裂開了。 大師笑著說：“因緣沒有不散的道理。 ”初三早上， 大師和湯氏訣別， 說：“恩愛無常， 生死誰也替不得誰。 我走啦， 你自己決定自己的事吧。 ”湯氏回答說：“夫君先走， 我隨後出家。 ”
3、隆慶辛未年間， 大師乞食梵村， 見雲棲這個地方山水幽寂， 產生了終老於此的志願。 此山本是已故高僧伏虎禪師所居寺廟遺址。
4、有一年大旱， 村民乞求大師禱雨。 大師笑著說：“我只知念佛， 沒有什麼法術。 ”眾人堅請不已， 大師不得已出山， 手擊木魚， 繞農田念佛。 足跡所至之處， 大雨隨注。 村民驚喜萬分， 爭相出資、出工、出木材， 為大師造屋。 在下地基時， 挖出了原來寺廟的立柱基石。 大家說：“這是舊雲棲寺的。 大師福佑我們全村， 我們願使雲棲寺煥然一新， 讓福佑代代相傳。 ”新的寺院不幾天就建成了， 只是外邊沒有山門， 中間沒有大殿， 惟有禪堂裡住著和尚， 法堂上供奉這經像而已，
5、萬曆戊子年間， 瘟疫流行， 每日病死的超過千人。 太守余良樞請大師赴靈芝寺祈禱， 瘟疫果然頓止。
6、大師極意禁戒殺生， 推崇放生。 大師曾贖買寺前萬工池作為放生池， 並在他80誕辰之際， 又增廣擴大。 在府城中設立上方、長壽兩個放生池， 每年需指出銀錢100余金。 在山中設立放生所， 專門救贖、放養飛禽走獸， 費用全從僧人口中節減， 每年約需200石糧食。 各放生池所， 都設有專門守衛， 並定期宣示佛法。 即使那些喜歡鳴叫的鳥類，
7、大師道風傳播日廣， 海內賢人豪士， 無論在朝在野， 無不歸心感化。 如兵部尚書宋應昌， 吏部尚書陸光祖， 內宮宣諭張元忭。 再如司成馮夢禎、陶望全等， 上門請法的， 超過百人。 他們都是專程前來探求人生大事， 聞法之後， 無不心服口服， 成為大師的入門弟子。
侍郎左宗問：“念佛能大徹大悟嗎？”大師說：“返聞自性， 性成無上道， 又何疑返念念自性耶？”
仁和縣令樊良樞問：“心亂妄想多， 如何能得到清淨？”大師說：“置之一處（心住一境）， 無事不辦。 ”
8、大師生平特別珍惜福報， 曾手著32條警語以自勉。 到垂老之年， 仍然自己洗衣服， 倒尿盆， 不願意讓別人代勞。 終身布衣素服一頂麻布幃帳， 本是母親去世那年做的， 直至他自己往生時還在使用， 其他的東西可以類推而知。
9、臨終前半個月，大師預先入城，告別各位故友即在家弟子，但只是說：“我要去別的地方了。”回山之後，連續幾日下齋堂，親自操作茶湯設供，並與眾僧話別：“我不在這兒住了，要去別處。”7月初一晚上，大師進入大堂坐下，囑咐大眾說：“我的話大家可能不愛聽，我就像風中的燈燭，油盡燈幹了，只等一撞一跌，才相信是真的。明天我要出遠門了。”第二天夜裡，大師在方丈室，示現輕微疾病，閉目念佛。城中諸位弟子趕到，圍繞著大師。大師留下遺言說：“大家要老實念佛，不要裝模作樣，不得標新立異，壞我規矩！”
大師的著述《雲棲法匯》一書，真是度世的寶船、法門的柱石。其中經典注疏及《竹窗隨筆》等20多種著作，都風行於天下。大師平日教誡弟子：貴真實修行，勿顯示神異。所以大師的許多神奇的故事，未曾記載流傳。
後記：至今讀來，祖師事蹟，仍令人神往9、臨終前半個月，大師預先入城，告別各位故友即在家弟子，但只是說：“我要去別的地方了。”回山之後，連續幾日下齋堂，親自操作茶湯設供，並與眾僧話別：“我不在這兒住了，要去別處。”7月初一晚上，大師進入大堂坐下，囑咐大眾說：“我的話大家可能不愛聽，我就像風中的燈燭，油盡燈幹了，只等一撞一跌，才相信是真的。明天我要出遠門了。”第二天夜裡，大師在方丈室，示現輕微疾病，閉目念佛。城中諸位弟子趕到，圍繞著大師。大師留下遺言說：“大家要老實念佛，不要裝模作樣，不得標新立異，壞我規矩！”
大師的著述《雲棲法匯》一書，真是度世的寶船、法門的柱石。其中經典注疏及《竹窗隨筆》等20多種著作，都風行於天下。大師平日教誡弟子：貴真實修行，勿顯示神異。所以大師的許多神奇的故事，未曾記載流傳。
後記：至今讀來，祖師事蹟，仍令人神往