甲真菌病的治療原則
在明確診斷後， 需要對甲真菌病進行治療。 在治療前， 與患者進行良好的溝通， 建立信任有助於提高治療的依從性。 治療時需正確的選擇抗真菌藥物， 並制定出合理的個性化治療方案， 例如：對於老年患者應適當延長療程。 治療過程中應儘量避免甲受壓、外傷、嵌甲等情況發生， 對伴有細菌感染的甲溝炎、甲床炎等應及時治療。 若家庭中有其他成員也患有甲真菌病的情況下， 需要同時接受治療。
因為甲板角質層厚且生長緩慢， 藥物難以滲透進入甲板， 故治療比較困難， 關鍵是堅持用藥至足療程。
治療的方法
1.局部外用治療
此治療方法常用於淺表型和未累及甲根部的甲真菌病。 先用小刀或指甲銼儘量去除病甲， 可以採用40%尿素軟膏封包病甲使之軟化剝離， 再外用抗真菌製劑；也可用5%阿莫羅芬甲擦劑每週1-2次外塗於受累的甲板或8%環吡酮胺甲塗劑每日1次外塗於病甲。 阿莫羅芬甲擦劑能在甲板上形成一層非水溶性的膜， 膜中含有高濃度的阿莫羅芬， 能快速滲透進甲床， 並可在甲上停留一個星期， 也使之易於釋放並滲入甲板。
2.口服藥物治療
特比萘芬口服（250mg/d口服）或伊曲康唑衝擊治療（400mg/d， 分2次口服）。 根據患者甲板生長速度，
3. 聯合治療
近年來， 甲真菌病的治療趨向於選擇個性化治療方案， 即針對患者個人因素選擇合適的治療方案。 可以選擇口服治療聯合外用藥物治療， 或者口服治療聯合拔甲治療。 甲損害的類型及嚴重程度， 患者是否伴有其它甲病， 感染病原菌的種類；患者的年齡、健康狀況、經濟承受能力及依從性；藥物的不良反應和禁忌症等因素都是制定個性化治療方案要考慮的因素。
方法的選擇
根據甲損害的類型選擇治療方案：
1.遠端側位甲下型（DLSO）：如果損害距離甲根部1/3以上，
2．近端甲下甲型（PSO）：口服治療或者聯合治療。
3．淺表白甲型（SWO）：局部治療或口服治療。
4．甲板內型(EO) ：口服治療或局部治療。
5．全甲破壞型（TDO）：聯合治療。
影響甲真菌病療效的因素
1.甲損害的程度：根據臨床分型來看， PSO和TDO因為甲根部受累， 所以治療較另外三型困難。
2.甲板生長的速度：其與年齡密切關係， 25歲以前病甲的生長速度是最快的， 隨著年齡的增長， 甲板的生長速度是在逐漸減慢的， 80歲以後甚至可以降到以前的50%。 而不同的位置甲板生長的速度也不一樣， 指甲生長的速度約為趾甲的3倍。
3.真菌侵襲甲板的速度：甲真菌病治癒的時間長短取決於病甲生長的速度， 當病甲生長的速度大於真菌侵襲甲板的速度時， 病甲可不治自愈；反之則病變進展；當兩者速度相等時， 則病甲處於靜止狀態。
藥物不良反應的檢測
處方前應仔細詢問患者的肝炎史、服藥史、家族史、酗酒史及近期肝功能檢查情況等。 建議一般用藥前檢查一次， 用藥一個月時檢查一次， 用藥3個月時檢查一次。
用藥後， 若第一次檢測時發現肝酶升高超過正常值的50%時， 建議進一步監測。 若第二次檢測時肝酶持續升高則建議停藥並隨訪觀察肝功能。 治療患者中， 老年人的藥物不良反應要比年輕人多見。 隨著年齡的增大， 藥物不良反應的發生率也隨之增加。
對於治療失敗的病例應該仔細分析、重新評估、聯合用藥、延長療程、換藥或者拔甲。