控制蒼蠅的方法可分為三大類， 即物理方法、生物學方法和化學方法， 而最有效的控制措施是綜合使用這三種方法。
1、物理方法
在畜禽場內使用的物理方法就是及時地清除糞便， 應特別注意死角中的糞便和污水， 盡可能保持畜禽糞便乾燥。 首先應搞好畜禽場內的清潔衛生， 定期消毒。 其次要妥善處理清除的糞便， 及時拉走或堆積發酵處理。 畜禽場內的廢舊墊料和病死畜禽也要妥善處理。 對禽場要定期檢查飲水和餵料系統， 確保不漏水、不灑料。 撿蛋時， 儘量避免雞蛋破損。 適當調節雞舍的通風系統，
2、生物學方法
控制蒼蠅的生物學方法是在糞便中培養蒼蠅的天敵。 蒼蠅的天敵包括甲蟲、蟎和黃蜂等。 在自然情況下， 糞便中蒼蠅的天敵較少。 乾燥的畜禽糞便有利於蒼蠅天敵的發育。 我們可以定期在畜禽舍的糞便上投放蒼蠅的天敵。
3、化學方法
化學藥物是控制蒼蠅的最有效的方法。 化學藥物不僅可以殺死蒼蠅， 也可以殺死蠅卵和幼蟲。 化學藥物分為殺幼蟲和殺成蟲劑。
目前國內殺滅蠅幼蟲劑有（1）有機磷類（2）氨基甲酸酯類（3）昆蟲生長調節劑。 另外， 國內外也有通過飼料途徑控制蒼蠅的殺蟲劑出售，
殺成蟲劑：（1）有機氯類（2）有機磷類（3）氨基甲酸酯類
殺成蟲劑的施藥方法有以下幾種：（1）蠅類停止面施藥（2）空間噴灑（3）毒蠅繩（4）毒餌。
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