免疫檢查點抑制劑的臨床上的成功應用使腫瘤免疫治療成為熱點。
腫瘤基因“看上去無限多態性”使得一種通用腫瘤抗原疫苗治療各種腫瘤看上去有些天方夜談。
但新研究發現腫瘤中的一些共同改變有可能製造出HLA亞型特異的非個體化、多聚體新抗原癌症疫苗，
為將來臨床上廣泛應用點燃了希望。
靶向免疫治療之一免疫檢查點調節劑的臨床引用上的成功， 重新點燃了人們對腫瘤疫苗的興趣。
然而對眾多不同類型癌症的60000以上個體腫瘤基因改變的“最佳病例情景”分析結果提示：癌症基因“看上去無限多態性”使得“癌症治療最高境界”的通用疫苗仍舊是一場白日夢。
麻塞諸塞州劍橋Foundation Medicine, Inc 的資深科學家Ryan J. Hartmaier 博士和他的同事談到， 即使半通用HLA特異癌症疫苗得到研發， 它也只是與約0.3%的大眾人群中的小部分人相關。
研究者在一份2月24日線上發表於Genome Medicine 上的報告中稱，
"但是應用目前的新抗原預測方法， 該策略將只應用于小部分人群。 對全外顯子/基因組學測序的相似分析雖然說目前在臨床上不能大規模開展，
Hartmaier 在採訪中談到， “早期研究團隊將這項分析稱為雪片工程Project Snowflake ， 它當時揭示了癌症存在巨大的基因多樣性。 ”
每一個腫瘤都是獨一無二的。 即使來自於同一個特異的驅動突變癌基因效應的腫瘤也會有微小的其他改變。
他補充到， “當我們對臨床試驗中的紛繁複雜的各式反應感到困惑時， 記住這點會給我們帶來益處”。 針對患者個體的靶向癌症疫苗不僅在時間和金錢上不切實際， 而且研發的技術也不可能在大規模人群中開展。 研究者根據這點， 決定研究是否針對眾多不同的新抗原， 研發“非個體化”的免疫治療。 Hartmaier還說， 一個廣譜的疫苗針對眾多不同的腫瘤“可能被某些人看為癌症治療的天方夜談”。
對63220個各異的腫瘤，
運用新一代基因組學測序，
研究者發現約45%的突變（每個腫瘤中都有突變）至少含有他們篩選出的最多數量個體腫瘤中包含的10種突變中的一種。
運用電腦輔助分析預測什麼樣的變化可以作為靶向治療目標，
Hartmaier 和他的同事說， "在 KRAS G12C、PIK3CA E545K或 EGFR L858R改變驅動的腫瘤上證實是正確的， 可以作為範例” "我們因此假設仔細挑選出的突變/新抗原可以允許研發廣泛應用的半通用腫瘤疫苗”。 為了驗證該方法， 他們從資料庫中選擇了10個可能運用到最多數目個體腫瘤中的新抗原。 研究者發現在北美/歐洲人群中0.7%-2.5%兩個最常見的HLA-A/B亞型包含了至少一個改變， 可以產生一個預測到的新抗原。 他們估計與少於0.3%的人群相關。
此外， 研究者說， KRAS G12C 驅動的腫瘤在每個HLA亞型的0.8%和2.6%人群中產生了相似的結果， 提示“新抗原的靶標即使在主要的驅動突變中仍舊是高度各異的”。 重要的是， 這項分析根據獨特肽鏈， 而不是根據突變， 對“共同新抗原”作了精確定義。這對研發癌症抗原有重要意義。研究者稱，“特定突變能產生許多各異的肽鏈，每個有它們自己的MHC-I親和性。”他們對此作出解釋，研究的主要結論不可能受“靶向測序數據發生很大的改變”。
Hartmaier博士對Medscape Medical News說，雖然預測靶向免疫治療有多大的成功還為時過早，早期的實驗和臨床資料“非常令人鼓舞”。“檢查點抑制劑免疫治療的成功告訴我們將免疫系統作為治療工具將會對現行治療策略作出改變。許多人相信腫瘤免疫治療和基因特徵作為足夠成熟的學科，將靶向癌症免疫治療變成可行性治療手段。正因如此，對它們的潛在價值的認識令人激動”。
Hartmaier 博士說，但是將這些方法成規模、廣泛運用於臨床，而且令人負擔的起，還是有許多主要技術和配套措施上的阻礙。這項研究提供了“某些資料説明指導工作和[確定]是否有一些障礙，換句話說，個體化治療的需要可以被忽視，”他補充到技術取得顯著進步將使個體化腫瘤疫苗變得可行。”
他也指出研究的局限性，“尤其是公認難以預測的由MHC-II呈遞的新抗原，對非個體化腫瘤疫苗研製方法帶來了希望。仍然有許多工作需要完成。”
他預測，靶向免疫治療不可能成為“全部”，也許還需要與其他免疫治療聯用，如檢查點抑制劑。
他說，"如果臨床療效足夠強，我對這個領域能找到克服技術和配套阻礙的方法，使腫瘤靶向免疫治療普遍開展和更加低成本有效沒有任何疑問。”
這項研究得到Foundation Medicine 的資助。
點評：也許在將來找到的腫瘤共同新抗原使得通用抗原腫瘤疫苗一招殺“敵”真的成為現實。
參考文獻
http://www.medscape.com/viewarticle/876388
Hartmaier博士對Medscape Medical News說，雖然預測靶向免疫治療有多大的成功還為時過早，早期的實驗和臨床資料“非常令人鼓舞”。“檢查點抑制劑免疫治療的成功告訴我們將免疫系統作為治療工具將會對現行治療策略作出改變。許多人相信腫瘤免疫治療和基因特徵作為足夠成熟的學科，將靶向癌症免疫治療變成可行性治療手段。正因如此，對它們的潛在價值的認識令人激動”。
Hartmaier 博士說，但是將這些方法成規模、廣泛運用於臨床，而且令人負擔的起，還是有許多主要技術和配套措施上的阻礙。這項研究提供了“某些資料説明指導工作和[確定]是否有一些障礙，換句話說，個體化治療的需要可以被忽視，”他補充到技術取得顯著進步將使個體化腫瘤疫苗變得可行。”
他也指出研究的局限性，“尤其是公認難以預測的由MHC-II呈遞的新抗原，對非個體化腫瘤疫苗研製方法帶來了希望。仍然有許多工作需要完成。”
他預測，靶向免疫治療不可能成為“全部”，也許還需要與其他免疫治療聯用，如檢查點抑制劑。
他說，"如果臨床療效足夠強，我對這個領域能找到克服技術和配套阻礙的方法，使腫瘤靶向免疫治療普遍開展和更加低成本有效沒有任何疑問。”
這項研究得到Foundation Medicine 的資助。
點評：也許在將來找到的腫瘤共同新抗原使得通用抗原腫瘤疫苗一招殺“敵”真的成為現實。
參考文獻
http://www.medscape.com/viewarticle/876388