北京時間3月17日19點， 2016-17賽季歐冠1/4決賽的抽籤儀式在瑞士尼翁的歐足聯總部進行， 最終， 皇馬抽到了拜仁， 巴薩則遇到了尤文。 另外兩組對陣為馬競VS萊斯特城和多特VS摩納哥。
此次入圍歐冠八強的球隊為皇馬、巴薩、馬競、拜仁、多特、尤文、萊斯特城以及摩納哥， 西甲3隊， 德甲兩隊， 意甲、英超以及法甲各1隊， 其中皇馬、巴薩、拜仁、多特以及尤文都是前冠軍得主， 馬競和摩納哥的最好成績是亞軍， 而萊斯特城則是歷史首次晉級八強。 本賽季的戰績方面， 尤文及皇馬保持不敗， 前者6勝2平， 後者則是5勝3平， 巴薩、拜仁以及馬競也都是8戰6勝。
負責抽籤的是歐足聯副秘書長瑪律凱蒂以及本賽季歐冠決賽大使、威爾士傳奇球星伊恩-拉什， 拉什首先抽出的是馬競， 對手是萊斯特城；接下來是多特蒙德， 對手是摩納哥；拜仁對皇馬以及尤文對巴薩則是兩組真正的強強對決。
抽籤沒有任何限制， 來自同一國家協會的球隊可以相互交鋒， 也不設種子隊， 首先被抽出的球隊首回合將主場作戰。 1/4決賽首回合安排在4月11日及12日， 而次回合則將在4月18日及19日進行。 半決賽的抽籤安排在4月21日， 兩回合半決賽則將於5月2日-3日及5月9日-10日進行， 最終的決賽將於6月3日在威爾士國家體育場進行。