南懷瑾先生在臺灣時曾參與政事， 雖然南先生曾準確預言了中華民族在1987年之後轉運， 但他也曾錯誤舉薦了台獨分子李登輝。 具體經過詳見著名作家， 《人民日報》原高級記者卞毓方先生的文章：
錯薦李登輝
1990年12月31日， 兩岸密使第一次會談， 左起：蘇志誠、楊斯德、南懷瑾、賈亦斌
1983年歲末， 一天夜裡， 都兩點了， 南懷瑾尚在燈下苦讀， 忽聽有人敲門， 誰呀？開門一看， 原來是他的學生馬紀壯， 但見他身穿睡衣， 腳踏拖鞋， 快步而入。 馬紀壯時為總統府秘書長， 夤夜穿著睡衣來訪， 肯定是有火燒眉毛的急事。
“什麼事？如此匆忙。 ”南懷瑾問。
“老師， 您怎麼看丘創煥、林洋港、李登輝這三個人？”馬紀壯不等落座， 便開門見山。
噢， 南懷瑾一聽這三個名字， 就明白馬紀壯的來意。 他不吭聲， 靜聽馬紀壯細述。 原來， 蔣經國清楚自己健康不佳， 隨時都有可能撂挑子， 因此， 誰當下一任的副總統人選， 就舉足輕重， 大意不得。 在蔣經國眼裡， 現任副總統謝東閔人還不錯， 可惜年紀大了， 本人不想續任；曾經刻意培養的孫運璿， 近來又突然中風， 派不上用場。 想來想去， 蔣經國腦子裡只剩下省主席丘創煥、內政部長林洋港， 以及臺北市長李登輝。
南懷瑾恍然， 馬紀壯此番問計， 多半是銜命而來。
“嗯， 我跟這三個臺灣人， 都沒什麼交情呐， 很難說得出具體意見。 ”南懷瑾不想攙合党國要事， 遲遲不予表態。 馬紀壯一直蘑菇到三點多， 看來， 他今夜得不到明確回答， 就不會走。 南懷瑾無奈， 只好端出自己的看法， 他說：“丘創煥太滑頭；林洋港有野心；若以蔣經國的立場來看， 大概李登輝比較適合。 第一， 他是農業專家；第二， 他是臺灣人；第三， 最重要的是他沒有後代。 ”
馬紀壯等的就是這幾句話， 他拱手相謝， 說：“我懂了。 ”隨即匆匆離去。
蔣經國當然不會僅僅徵求南懷瑾一個人的意見， 但是， 他在普遍諮詢過一幫政要後， 最終採納的， 恰恰是南懷瑾的進言——選擇李登輝為副總統候選人。
李登輝嗣後在政治舞臺上的表演， 令南懷瑾大失所望， 每與人談起， 他都懊悔當初薦錯了人。
初到臺灣的南懷瑾