在整個二戰中， BF109的各種改進型號都是德國空軍戰鬥機部隊主力中的主力， 各種先進的me262、FW190戰鬥機其實都是配角。 但是就是這樣一款充當主力的戰鬥機在二戰初期德軍的心目中卻並不是最受重視的， 戰爭初期德軍最看重的戰鬥機是BF110雙發重型遠端戰鬥機。
和BF109輕型戰鬥機一樣， BF110在戰前就開始研發製造。 它基於這樣一種用途， 既為執行遠端轟炸任務的轟炸機做掩護， 與敵方戰鬥機進行空戰。 飛行速度和火力遠遠高於當時的輕型戰鬥機， 最初型號飛行速度便可以達到600公里。 裝備有2門機炮和4挺機槍， 這對於戰爭初期大多數僅僅裝備機槍的戰鬥機來說強很多。 此外還可以掛載炸彈（後期改進型號最高能夠掛載2000公斤炸彈）， 執行對地攻擊任務。
廣泛的用途受到了納粹的重視， 被視為“萬能戰鬥機”！不過1940年爆發的英倫空戰卻讓這種戰鬥機名聲掃地， 由於雙發結構導致機動不靈活， 與英軍的單發戰鬥機空戰時受到了一邊倒的屠殺， 有時候甚至需要同為戰鬥機的BF109來護航。 慘重的損失導致BF110最後不得不退出晝間空戰。 從英倫空戰後， 它再也不敢以戰鬥機的身份來進行空戰了。
不過德軍在隨後的戰爭中將它改為了對地攻擊機， 改進型號的彈藥裝載能力不亞於輕型轟炸機， 在蘇德戰爭中應用非常廣泛。 在英美對德進行大轟炸後， 德軍將它改為了夜間攔截機， 機頭裝上了雷達， 可以輕易的擊落夜間飛行的盟軍重型轟炸機。