調查瞭解，
禽畜糞便養分全面，
含有豐富的氮、磷、鉀等微量元素，
是植物生長必備的營養物質；含有豐富的纖維素、半纖維素等物質；還含有一些可以刺激作物根系生長的物質以及各種有益的土壤微生物。
通過調節畜禽糞便中的碳氮比和人工控制水分、溫度、酸鹼度等條件，
利用微生物的發酵作用處理畜禽糞便，
生產有機肥料。
以下是禽畜糞便轉化為肥料的方法有5類加工法：
自然堆漚發酵法
自然堆漚發酵法將畜禽糞便堆放在發酵池裡， 用秸稈將表面覆蓋， 經過長時間的自然厭氧發酵(有的長達幾年)， 到施肥季節時， 直接施入地裡。 這種方式在偏遠地區的小農場曾廣泛採用， 其主要原因：一是小農場地處偏遠地區， 遠離居民區， 地域遼闊；二是自然堆漚發酵好的肥料在小農場內部就近使用， 不必遠距離運輸。 但中國集約化畜禽養殖場大多集中在城市郊區， 離居民區很近， 周圍沒有大量土地可以就近消納源源不斷產生的畜禽糞便。
晾曬乾燥法
晾曬乾燥法是將畜禽糞便均勻攤放在場地上， 利用太陽能進行自然乾燥。 該方法投資少， 成本低， 但占地面積大， 而且乾燥處理過程中會產生臭氣， 污染周邊的空氣環境。 肥料養分損失多， 且雨雪季節難以正常生產， 產品較難達到無害化要求。 該方法適合於畜禽散養戶處理零星畜禽糞便， 不適合於集約化畜禽養殖場處理量大而集中的畜禽糞便。
直接快速烘乾法
直接快速烘乾法是採用高溫熱煙道氣將畜禽糞便直接烘乾、滅菌， 並將產品含水率控制在安全貯存水分以下的快速處理方法。 直接快速烘乾法具有快速加工、操作簡單、產品品質好、不受氣候限制和可連續生產等優點， 20世紀90年代曾被廣泛應用於集約化養雞場的糞便處理。
採用塔樓式鋼架結構， 先將調節好水分的新鮮畜禽糞便移送到塔樓最上層的承料翻板上。 承料翻板每天翻動一次，將畜禽糞便從最上層移動到下一層的翻板，如此類推，實現畜禽糞便從塔樓最上層逐層下移，經過15天左右的發酵過程，水分可降至40%左右。該方法的優點是發酵效果好，二次污染小。但其致命的缺點是塔樓主體結構為鋼結構，一次性投資很大;畜禽糞便直接和承料翻板接觸，設備腐蝕嚴重，甚至有的存在安全隱患，發酵塔使用壽命短;北方寒冷地區冬季需加溫才能保證好氧發酵正常運行。
沼氣厭氧發酵和動物蛋白生產法
沼氣厭氧發酵是以畜禽場的糞便為原料，在沼氣發酵裝置中隔絕氧氣的條件下，通過微生物的作用，最終將其中的碳元素分解為能源物質沼氣。沼氣厭氧發酵法適於處理集約化畜禽養殖場採用水沖式(或水泡式)清糞工藝的液態畜禽糞尿。
畜禽養殖過程中的幹清糞還可在堆肥發酵過程生產有機肥的同時，養殖蚯蚓、蠅蛆、黑水虻等，獲得的動物蛋白用於製作飼料等。這幾種生物有著極強的禽畜糞便處理能力，畜禽糞便經其處理後再施用，速效N、P、K顯著增加，有效P和礦質N提高很多，糞便的肥效大大提高。
承料翻板每天翻動一次，將畜禽糞便從最上層移動到下一層的翻板，如此類推，實現畜禽糞便從塔樓最上層逐層下移，經過15天左右的發酵過程，水分可降至40%左右。該方法的優點是發酵效果好，二次污染小。但其致命的缺點是塔樓主體結構為鋼結構，一次性投資很大;畜禽糞便直接和承料翻板接觸，設備腐蝕嚴重，甚至有的存在安全隱患，發酵塔使用壽命短;北方寒冷地區冬季需加溫才能保證好氧發酵正常運行。 沼氣厭氧發酵和動物蛋白生產法
沼氣厭氧發酵是以畜禽場的糞便為原料，在沼氣發酵裝置中隔絕氧氣的條件下，通過微生物的作用，最終將其中的碳元素分解為能源物質沼氣。沼氣厭氧發酵法適於處理集約化畜禽養殖場採用水沖式(或水泡式)清糞工藝的液態畜禽糞尿。
畜禽養殖過程中的幹清糞還可在堆肥發酵過程生產有機肥的同時，養殖蚯蚓、蠅蛆、黑水虻等，獲得的動物蛋白用於製作飼料等。這幾種生物有著極強的禽畜糞便處理能力，畜禽糞便經其處理後再施用，速效N、P、K顯著增加，有效P和礦質N提高很多，糞便的肥效大大提高。