玄機科技製作的《秦時明月》系列動畫中， 諸子百家是和秦國相抗衡的勢力， 農家與墨家、項氏一族三方形成了秘密聯盟， 一同制定“青龍計畫”用以對付帝國。 然而， 理想很美好現實更殘酷， 各家之間都有自己的利益算盤， 而且門派內部也都暗藏矛盾。
農家也只是其中一個典範罷了， 其實諸子百家幾乎都有不和存在。
1、道家：天宗和人宗之爭
秦時明月中道家雖然出場人物不多， 但逍遙子和曉夢大師二人卻都是頂尖高手， 道家在諸子百家中還是有些影響力的！逍遙子和曉夢大師分屬人宗、天宗， 兩宗之間的矛盾持續了數百年， 正因為如此兩人才有了“天人之約”。
2、鬼穀：縱橫不同道路之爭
作為鬼穀僅有的兩位傳人， 蓋聶和衛莊分別代表了縱橫家不同的選擇， 兩人從入門之時就已經形成競爭關係， 正是這樣的競爭才促使鬼穀繁榮昌盛八百年。 大叔和二叔之間並沒有什麼仇恨， 如同道家天人兩宗一樣， 只是彼此對道路的理解和選擇不同罷了。
3、墨家：存在著內奸， 人數不詳
墨家出場人數可能僅次於農家， 看似和和氣氣， 但其實暗藏殺機。 墨家前前任鉅子六指黑俠便是因為不同意青龍計畫而被東君焱妃所殺；墨家機關城的地點所在也是因為內部奸細而被流沙和公輸仇找到。 墨家內部到底有多少個內奸， 現在還不能確定！
4、陰陽家：左右兩大護法明爭暗鬥
陰陽家五大長老相對比較和睦， 目前還沒有看出什麼不和的地方。 但是左右護法月神和星魂二人之間的互相算計表現得比較明顯了， 星魂阻撓月神尋找姬如千瀧和幻音寶盒， 月神看到千瀧為天明攻擊星魂則在鏡前偷笑。
5、儒家
能夠真正不內鬥的當家人也就只有儒家了， 儒家出過李斯， 他如今效忠於帝國。 但李斯並沒有成為儒家的什麼大人物， 如今更是法家的代表人， 跟儒家幾乎沒有關係了。 張良雖然與顏路、伏念兩位師兄對反秦一事看法不同， 但他也只是以個人之力幫助天明等人罷了。