菲爾普斯生於美國的一個中產階級家庭, 跟很多從出生沒多久就展現出驚人天賦的“天才”們相比, 菲爾普斯要坎坷的多。
在很小時候, 菲爾普斯就被診斷出有注意缺陷多動障礙, 也就是多動症。 他無法專心做任何事情, 一刻都停不下來, 他的大耳朵、長手臂都能成為同學們嘴中的笑話。 在那段時光裡, 他需要靠藥物來讓自己“安靜”下來, 直到他遇到了游泳。 7歲那年, 他第一次有機會去俱樂部學游泳。
到了11歲, 菲爾普斯開始系統的訓練, 每週練7天, 每天遊5小時。 他的肺活量迅速提升到了15000毫升, 這讓他能夠在減少換氣次數, 以增加自己在水中的前行距離。 同時, 他的教練以成年游泳選手的標準動作要求菲爾普斯(把原來的每劃一次水打腿2次提高為6次)。
在2003年巴賽隆納世界游泳錦標賽期間, 他獲得6塊獎牌。 2004年雅典奧運會, 菲爾普斯奪得男子200米、400米個人混合泳, 100米、200米蝶泳, 4×200米自由泳接力和4×100米混合泳接力6枚金牌,