2007年， 積善堂在新疆吉木薩爾縣成立， 孔令新獨自開始了對前列腺疾病的深度鑽研。 這已經是孔令新對前列腺疾病的第13個年頭。
1991年， 孔令新進入蘭州軍區烏魯木齊總醫院， 開啟了他的從醫生涯。
在從醫之初， 孔令新就發現前列腺疾病發病率高， 而中西醫都沒有行之有效的治療方法。 前列腺疾病是大多數男性都不能回避的疾病。 它是男性性功能的殺手， 患上前列腺疾病的男性性功能遲早會受損。 其次， 腺體的老化是人體老化的必然， 所以到了一定的年齡， 腺體一定會出現增生引發一系列的症狀。
前列腺疾病患者分為兩類， 一類是很早就接受治療的， 在治療路上走得異常艱辛， 試遍了所有能找到的治療方法， 最終卻是病情沒有改善， 甚至更差；另一類是在病發初期完全不重視， 直到病情已經非常嚴重， 日常生活受到了嚴重的才開始治療， 之後就是長期的治療無效， 病情反復， 開始在治療的漫漫長路上掙扎。
男性功能的損傷是每一位男性都分外擔心的問題， 這也就造就了很多商機。 於是各種各樣的治療方法也應運而生。 很多治療方法對前列腺疾病根本不能緩解， 反而還會讓患者的病情加劇。 然而當時固有的治療方法卻對這個疾病難以奏效。
在醫院工作沒多久， 孔令新已經見過無數被前列腺疾病折磨的患者。
醫學界一直有一個共同的認知， 那就是：前列腺疾病的起因紛紜複雜， 難以說清。 孔令新則認為所有的疾病都是能找到病因的。 醫學上， 未知比已知的多。 他說：“我們所知有限， 所以在已知的基礎上， 要大膽的去探求未知， 才能找到病因。 有了病因， 我才能找到解決的方法。 ”
世間萬事， 敵不過“認真”二字。
人體是有再生功能的， 前列腺卻很難再生。 那能不能啟動呢？把已經僵死硬化的病灶進行啟動， 讓它再次煥發新生， 是不是就能解決僵死硬化這個問題？僵死硬化得到解決後， 腺體原有的功能會得到啟動漸漸趨近正常？如果真是這樣應該對前列腺疾病的治療有很大的幫助。
提出理論很簡單， 但要證實理論卻需要大量的實際工作。 尤其在沒有前鑒的情況下， 每一點進展的後面都是無數次的驗證。 很多人質疑這個理論， 孔令新說：“既然是未知，
如何讓僵死硬化的腺體啟動？
這是孔令新在治療路上遇上的第一個難題。 前列腺的表面覆蓋著一層脂質包膜。 包膜裡的彈性纖維和平滑肌有著豐富血管、神經、腺管和腺液， 包膜不止覆蓋於前列腺表面， 還深入到腺體內部形成前列腺的支架。 僵死硬化直接導致病灶部位的腺體腺液乾涸， 血管、神經、腺管萎縮。 那麼啟動就要讓腺體的病灶部位的血管、神經恢復其原有的功能。
為了啟動， 孔令新幾乎嘗試過所有的中藥材，
這就是前列腺疾病治療的關鍵：迴圈與代謝。 孔令新立刻研究啟動組方， 加速和加強腺體的啟動功效。 不停的在組方上進行調整， 力求達到直接有效而不傷害腺體。
就因為有了他認真刻苦的鑽研與不計其數的失敗與進展， 才有了ISA療法， 讓前列腺疾病患者開始走上康復之路。
自從2007年ISA療法在臨床治療中開始使用， 前列腺疾病的治療就翻開了新的一頁。很多慕名前來的患者都切身體會到了療效的神奇。
有一位8歲的小患者，因為尿餘瀝不盡內褲一直是濕的，包皮都漚爛了，百治無效。家長聽說了孔令新的名字，帶著小患者來求治，孔令新給小患者製造了藥丸，服用的第二天就見效，一周就痊癒了；一個前列腺結石患者，也是慕名前來，治療一個月放射區疼痛消除了，突然有一天出現強烈的尿路刺激症，患者自己說都夾不住尿了。兩天后，尿道前列腺部突然感到堵塞，幾個小時尿不出來，最後尿液積在膀胱，導致膀胱內壓力增大，尿路一下暢通，還排了一粒小結石出來。因結石頭劃破尿道，患者最後還滴了幾滴血，之後病情徹底痊癒，複查B超前列腺內的結石也消失了。
有一位老年患者因為前列腺增生進行手術，術後受涼引發病情惡化，傷口產生大量血塊堵塞患者尿道引發急性尿瀦留，患者痛苦不堪的同時面臨再次手術。患者因不願再次接受手術，轉到積善堂治療。孔令新用自己豐富的經驗給患者進行了治療，隨著血塊的排出，患者的痛苦減輕。第二天下午，患者的排尿困難解除，尿液變得清澈。第三天下午患者的問題基本康復。
浙江的一位患者，患前列腺疾病多年，在當地治療無效，專門在網上諮詢了自己的病情，通過網路會診在積善堂醫治，經歷11個療程，結石成功化除。從頭到尾他沒有見過孔令新，但卻切身感受到了孔令新的高明醫術。
因為前列腺疾病導致不育，接受ISA療法治療後讓妻子懷孕，之後生下健康活潑寶寶的患者更是比比皆是。這些患者大多數是在治療過程中就讓妻子懷孕的，非常擔心治療會影響孩子健康，但孩子生下來都健康活潑。這足以證明ISA療法是針對患者病灶進行的健康、綠色的療法。
在ISA推向患者後，康復的病例實在太多太多，可以信手掂來。孔令新沒有因這些患者的康復而止步不前，他一直在提升療效，改善藥品上努力。
2011年，有一位患者專程來找到了他，這位患者30歲左右，在2007年時被確診為慢性前列腺炎。之後他就開始了治療，多種治療方法嘗試過無效後，這位患者在半年內接受了大量的理療和熱療，然後患者就感覺自己體內多了一個硬塊，常常疼痛。同時，患者的性功能也完全喪失。來到積善堂的時候，這位患者的腺體萎縮嚴重，腺體僵死硬化病情已經不能康復，在檢查初期，積善堂就已經把這個結果告訴了患者。但是患者堅持要治療，希望能出現奇跡。
為此，孔令新專門與患者進行了溝通。說明了不能康復的原因，說：“醫學是科學，我們不弄虛作假。你的病情已經超出了我的能力。”患者說：“我已經沒路可走了，如果你不能為我治療，我這一輩子就沒有希望了。”最終堅持在積善堂治療了兩年，經過治療，他的很多身體症狀都得到了緩解，但是不能完全康復，尤其是性功能完全喪失。他的腺體能啟動的部分在積善堂的治療下得以保持健康的功能，而他的腺體已經僵死了整個體積的一半以上，僵死部分體積太大，孔令新也束手無策。
兩年後這位患者感謝了孔令新，他說：“我非常感謝你，如果我早點找到你，我也不會是這樣。”這位患者的最初的病因僅僅是前列腺纖維化。這是前列腺疾病發展的第二個階段，這在積善堂治療過的大多數患者身上，很快就能康復。而這位患者卻發展到了再也沒有辦法治療，這不僅是他的健康受損，他的人生也因此沒有了希望。而這位患者，也讓孔令新重新審視了自己今後的目標。之前他一直把精力放在前線為患者治療，同時把自己的治療技術傳授給了積善堂的各位醫生及主任。但這位患者的痛苦讓他發現自己應該讓ISA 療法不斷的向前推進，不僅提升療效，還要縮短療程。
從那以後，孔令新把自己的精力轉而投入到病情的更深入研究與藥效的提升上。他一直對藥品的要求嚴格苛刻，採購來的藥品如不能達到他的要求，堅決不用。每一樣藥材入庫之前都親自檢查，絕不降低自己的要求。
積善堂ISA療法需要用到一味核心藥材，這種藥材藥性剛猛，殺伐氣很重，用在體格健壯的人身上沒有問題，但是對於體質較弱的人，就顯得有些過猛，容易傷正氣。這個問題困擾了孔令新很長一段時間，直到有一天他和幾個哈薩克族老鄉一塊兒喝酒，微醺之際忽然茅塞頓開，好酒都要經過長時間窖藏，才能香氣悠長，口味綿軟，那這味猛藥是否也可以採用窖藏的方式來改良它的藥性呢？當天晚上，他就把一批藥材裝罐埋在了地下的泥土中，三個月，半年，一年，期間他不斷自己服用窖藏藥物，感受身體的反應，終於，兩年後大功告成，衝殺猛烈的藥性，被馴服了，變成了緩慢起效，長久釋放藥性。按照孔令新的說法，這叫接地氣，藥材來源於大地，也只有大地之母能磨平他的烈性。
對於積善堂的醫生和主任，孔令新也有著嚴格的要求。每當技術出現新突破，他會把進展通知到積善堂的每一個人，並且進行相應的業務培訓。隨著時間的推進，很多患者都反應療效顯效越來越快，從前需要十天顯現的療效，現在三天就可以感覺到。還有患者是治療當天就感覺到療效的。
十年過來，在積善堂康復的患者數以萬計，深圳、南京、西安、鄭州門診的技術與新疆的總部同步，每年接獲患者無數感謝。但孔令新依舊堅持初衷：療效與口碑並重。認真治療，透明收費。免費檢查和診斷，不治療無收費，接受治療後無隱形收費。對患者講真話，讓患者對自己的病情有一個清楚的瞭解。
這在追求利益的時代是多麼難得。很多人質疑，如果你檢查和診斷都不收費那你的收入不就少了很多？對患者講了真話患者不是就會流失嗎？
對於這些，孔令新都只回答：“在積善堂，這些都不是要考慮的問題。作為醫生，尤其是中醫，為患者診斷和檢查是可以減縮患者就醫成本的事情，一定要做。而對患者撒謊只會讓患者對醫生喪失信任，所以一定要真誠。患者的選擇一定要尊重。如果患者選擇了積善堂，那積善堂就一直要實事求是，認真治療。如果患者不選擇我，說明我們有做得不好的地方，我們還要認真的改進。”
前列腺疾病的治療就翻開了新的一頁。很多慕名前來的患者都切身體會到了療效的神奇。有一位8歲的小患者，因為尿餘瀝不盡內褲一直是濕的，包皮都漚爛了，百治無效。家長聽說了孔令新的名字，帶著小患者來求治，孔令新給小患者製造了藥丸，服用的第二天就見效，一周就痊癒了；一個前列腺結石患者，也是慕名前來，治療一個月放射區疼痛消除了，突然有一天出現強烈的尿路刺激症，患者自己說都夾不住尿了。兩天后，尿道前列腺部突然感到堵塞，幾個小時尿不出來，最後尿液積在膀胱，導致膀胱內壓力增大，尿路一下暢通，還排了一粒小結石出來。因結石頭劃破尿道，患者最後還滴了幾滴血，之後病情徹底痊癒，複查B超前列腺內的結石也消失了。
有一位老年患者因為前列腺增生進行手術，術後受涼引發病情惡化，傷口產生大量血塊堵塞患者尿道引發急性尿瀦留，患者痛苦不堪的同時面臨再次手術。患者因不願再次接受手術，轉到積善堂治療。孔令新用自己豐富的經驗給患者進行了治療，隨著血塊的排出，患者的痛苦減輕。第二天下午，患者的排尿困難解除，尿液變得清澈。第三天下午患者的問題基本康復。
浙江的一位患者，患前列腺疾病多年，在當地治療無效，專門在網上諮詢了自己的病情，通過網路會診在積善堂醫治，經歷11個療程，結石成功化除。從頭到尾他沒有見過孔令新，但卻切身感受到了孔令新的高明醫術。
因為前列腺疾病導致不育，接受ISA療法治療後讓妻子懷孕，之後生下健康活潑寶寶的患者更是比比皆是。這些患者大多數是在治療過程中就讓妻子懷孕的，非常擔心治療會影響孩子健康，但孩子生下來都健康活潑。這足以證明ISA療法是針對患者病灶進行的健康、綠色的療法。
在ISA推向患者後，康復的病例實在太多太多，可以信手掂來。孔令新沒有因這些患者的康復而止步不前，他一直在提升療效，改善藥品上努力。
2011年，有一位患者專程來找到了他，這位患者30歲左右，在2007年時被確診為慢性前列腺炎。之後他就開始了治療，多種治療方法嘗試過無效後，這位患者在半年內接受了大量的理療和熱療，然後患者就感覺自己體內多了一個硬塊，常常疼痛。同時，患者的性功能也完全喪失。來到積善堂的時候，這位患者的腺體萎縮嚴重，腺體僵死硬化病情已經不能康復，在檢查初期，積善堂就已經把這個結果告訴了患者。但是患者堅持要治療，希望能出現奇跡。
為此，孔令新專門與患者進行了溝通。說明了不能康復的原因，說：“醫學是科學，我們不弄虛作假。你的病情已經超出了我的能力。”患者說：“我已經沒路可走了，如果你不能為我治療，我這一輩子就沒有希望了。”最終堅持在積善堂治療了兩年，經過治療，他的很多身體症狀都得到了緩解，但是不能完全康復，尤其是性功能完全喪失。他的腺體能啟動的部分在積善堂的治療下得以保持健康的功能，而他的腺體已經僵死了整個體積的一半以上，僵死部分體積太大，孔令新也束手無策。
兩年後這位患者感謝了孔令新，他說：“我非常感謝你，如果我早點找到你，我也不會是這樣。”這位患者的最初的病因僅僅是前列腺纖維化。這是前列腺疾病發展的第二個階段，這在積善堂治療過的大多數患者身上，很快就能康復。而這位患者卻發展到了再也沒有辦法治療，這不僅是他的健康受損，他的人生也因此沒有了希望。而這位患者，也讓孔令新重新審視了自己今後的目標。之前他一直把精力放在前線為患者治療，同時把自己的治療技術傳授給了積善堂的各位醫生及主任。但這位患者的痛苦讓他發現自己應該讓ISA 療法不斷的向前推進，不僅提升療效，還要縮短療程。
從那以後，孔令新把自己的精力轉而投入到病情的更深入研究與藥效的提升上。他一直對藥品的要求嚴格苛刻，採購來的藥品如不能達到他的要求，堅決不用。每一樣藥材入庫之前都親自檢查，絕不降低自己的要求。
積善堂ISA療法需要用到一味核心藥材，這種藥材藥性剛猛，殺伐氣很重，用在體格健壯的人身上沒有問題，但是對於體質較弱的人，就顯得有些過猛，容易傷正氣。這個問題困擾了孔令新很長一段時間，直到有一天他和幾個哈薩克族老鄉一塊兒喝酒，微醺之際忽然茅塞頓開，好酒都要經過長時間窖藏，才能香氣悠長，口味綿軟，那這味猛藥是否也可以採用窖藏的方式來改良它的藥性呢？當天晚上，他就把一批藥材裝罐埋在了地下的泥土中，三個月，半年，一年，期間他不斷自己服用窖藏藥物，感受身體的反應，終於，兩年後大功告成，衝殺猛烈的藥性，被馴服了，變成了緩慢起效，長久釋放藥性。按照孔令新的說法，這叫接地氣，藥材來源於大地，也只有大地之母能磨平他的烈性。
對於積善堂的醫生和主任，孔令新也有著嚴格的要求。每當技術出現新突破，他會把進展通知到積善堂的每一個人，並且進行相應的業務培訓。隨著時間的推進，很多患者都反應療效顯效越來越快，從前需要十天顯現的療效，現在三天就可以感覺到。還有患者是治療當天就感覺到療效的。
十年過來，在積善堂康復的患者數以萬計，深圳、南京、西安、鄭州門診的技術與新疆的總部同步，每年接獲患者無數感謝。但孔令新依舊堅持初衷：療效與口碑並重。認真治療，透明收費。免費檢查和診斷，不治療無收費，接受治療後無隱形收費。對患者講真話，讓患者對自己的病情有一個清楚的瞭解。
這在追求利益的時代是多麼難得。很多人質疑，如果你檢查和診斷都不收費那你的收入不就少了很多？對患者講了真話患者不是就會流失嗎？
對於這些，孔令新都只回答：“在積善堂，這些都不是要考慮的問題。作為醫生，尤其是中醫，為患者診斷和檢查是可以減縮患者就醫成本的事情，一定要做。而對患者撒謊只會讓患者對醫生喪失信任，所以一定要真誠。患者的選擇一定要尊重。如果患者選擇了積善堂，那積善堂就一直要實事求是，認真治療。如果患者不選擇我，說明我們有做得不好的地方，我們還要認真的改進。”