崔永元這次發飆還點名了包括人民網、新華網在內的跟進此事的各大知名媒體， 稱“那些所謂的主流媒體裝聾作啞。 看到一篇抺黑崔永元的便峰擁而上，
一、璞谷塘商城售賣的商品高於市價5倍以上。
崔永元稱， “商品和商品不一樣， 你是和早市比嗎？”還舉例子， 橄欖油更高檔的有3000元一瓶的， 外國人吃十種八種鹽都不新鮮， 寫文章稱自己“所售橄欖油的價格約為市場價4到58倍”的作者是瞎折算。
商品價格過高， 純屬扯淡， 同品質的商品價格更高。 老百姓買不起應該去抗議農業部， 它們的存在就是讓老百姓人人吃得上健康食品， 崔永元的公司沒這義務。 再吵吵， 還漲價， 說到做到。
值得一提的是， 崔永元還表示報導記者並沒有採訪他， 但是“不怪你， 現在記者大部分是這個操行”。
二、文中存在事實性錯誤。
對於報導中提到崔永元是在2014年赴美考察拍攝關於轉基因的紀錄片後， 才與方舟子發生論戰一事， 崔永元指出兩者先後時間有誤。
小財很容易就查詢到崔永元和方舟子的罵戰是在2013年9月， 約半年之後， 崔永元推出了他自費到美國拍攝的一部長達68分鐘的轉基因調查紀錄片。
三、崔永元坐擁十多家公司。
崔永元表示這都是因為原來的夥伴辭職辦公司希望借用他的名氣請他做股東， 他到至今為止不是任何一家公司的法定代表人， 沒拿過分紅和工資。
據天眼查， 與崔永元相關的公司共9家， 其中4家是與食品行業相關。 璞穀塘網站的擁有者“璞谷塘崔永元食品文化交流俱樂部有限公司”是一家在吉林延邊註冊的公司， 註冊於2016年12月， 公司的法定代表人為柴斌， 崔永元擔任監事長。
該公司的大股東是占股達99%的璞谷塘原生態農產品開發股份有限公司， 崔永元在這家原生態農產品公司中占股35%。
四、商品介紹中的“非轉基因”字眼消失。
報導中質疑“反轉基因鬥士”崔永元的商城僅有一款商品標明“非轉基因”，
崔永元的回應是2015年農業部下發的《關於指導做好涉轉基因廣告管理工作的通知》提到， 如果是轉基因食品， 必須標注轉基因；如果該類作物不存在轉基因， 不允許標注非轉基因， 農業部不讓標就是怕轉基因食物賣不出去。
五、璞穀塘商品檢測報告與國家最低上市標準QS相差無幾， 並沒有高於該標準。
崔永元說璞穀塘的產品介紹中並沒有明確表示符合綠色食品和有機產品認證， 但他們大部分產品都遠遠超過綠色有機標準， 不想去認證， 因為現在市場上有機比雞還多， 沒人信。
六、預付費會員制有非法集資之嫌。
對於記者把商城的會員制付費模式和銀監會關於要“嚴密防範利用預付消費進行非法集資”的消息放在一起，
七、網站盜用友商展示圖。
這是後續跟進媒體指出的問題， 面對截圖鐵證， 崔永元承認並表示：“關於網站盜圖， 屬實， 不再申辨原因， 比如盜圖不影響產品品質……這樣很無恥。 ”
歸根到底，崔永元開食品商城這事之所以會引起如此大的爭議，就在於有人提出他先是為轉基因氾濫作鬥爭，讓其“反轉鬥士”形象深入人心之後，再借此謀取巨額利潤。
崔永元在視頻中說，自己通過在電視臺主持節目、幫樓盤剪綵、主持晚會等方式掙錢要更容易，“都是論分鐘算，15分鐘就把錢掙回來了”，認為他做有機食物是為了牟利的，都是“轉基因吃多了”。
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歸根到底，崔永元開食品商城這事之所以會引起如此大的爭議，就在於有人提出他先是為轉基因氾濫作鬥爭，讓其“反轉鬥士”形象深入人心之後，再借此謀取巨額利潤。
崔永元在視頻中說，自己通過在電視臺主持節目、幫樓盤剪綵、主持晚會等方式掙錢要更容易，“都是論分鐘算，15分鐘就把錢掙回來了”，認為他做有機食物是為了牟利的，都是“轉基因吃多了”。
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