根據我最近幾年的研究, 至少從東晉南朝開始, 文獻裡面已經出現了“秦淮”的名稱, 但還不普遍, 真正用“秦淮”的名稱取代“淮水”,
秦淮河與南京的歷史文化淵源特別密切, 南京歷史上許多重要的歷史事件、歷史人物都與秦淮河有關。 在南京, 不管是文獻記載, 還是在民間流傳, 都有一個與秦淮河相關的傳說:秦始皇斷長壟, 泄王氣。
在南京江寧境內, 有兩段秦淮河明顯存在比較早期的人類開鑿痕跡:一段是在今天方山的西面, 到石硊山之間的支流有人工開鑿的痕跡;另外一段從今天方山南面的東北村, 到今天湖熟街道龍都的這一段, 5公里長的河道明顯有人工開鑿的痕跡。 根據我們搜集的東晉和南朝的文獻記載, 有些線索表明這兩段秦淮河是在秦始皇時期開鑿的。 另外, 還有一個重要的依據, 為什麼在漢代, 在湖熟這個地方設置一個縣?這也與在秦始皇時期開鑿了從東北村到龍都的這段秦淮河有關係。