冬季辣椒育苗期間， 往往會突然受到寒流的襲擊， 溫度驟然降低， 秧苗容易受凍害。 如果溫度是緩慢降低， 則秧苗不易結冰受凍；如溫度雖然不是太低， 但低溫持續時間很長， 特別是低溫與陰雨相伴隨， 秧苗也很容易發生凍害。 秧苗受凍害的輕重， 還與低溫過後氣溫回升的快慢有關。 若氣溫緩慢回升， 秧苗解凍也慢， 易恢復生命活力；如果升溫和解凍太快， 秧苗組織易脫水乾枯， 造成死苗。 辣椒苗防凍措施有如下幾方面。
改進育苗方法 利用人工控溫育苗方法， 如電熱溫床和工廠化育苗等， 是解決秧苗受凍問題的根本措施。
增強秧苗抗寒力 避免秧苗徒長， 在寒流來臨前儘量揭去覆蓋物， 讓苗多照光和接受鍛煉。 在雨雪低溫期間， 儘量利用天氣放晴間隙， 揭掉草簾， 讓辣椒苗照到陽光。 雨雪停後猛然轉晴時， 中午前後在苗床上蓋幾塊草簾， 避免秧苗失水萎蔫。 床土濕度大， 秧苗易受凍害， 所以寒潮來臨前要控制苗床澆水， 床土過濕的可撒一層幹草木灰吸濕。
合理施肥 增施磷鉀肥， 苗期使用抗寒劑。 秧苗噴施0.5％～1％的紅糖或葡萄糖水， 可增強抗寒力。 在3～4葉期噴施2次（間隔7天）0.5％氯化鈣溶液， 可增強抗寒性。
保溫防凍 寒潮期間嚴密覆蓋苗床。 進行短時間通風換氣時， 要防止冷風直接吹入床內傷苗。 夜晚加蓋草簾。 可將稻草枯葉撒在秧苗上，