有機磷類、氨基甲酸酯類、擬除蟲菊酯類殺蟲劑和二硫化氨基甲酸衍生物殺菌劑(福美雙、代森鋅、代森錳鋅等)農藥鹼性條件下會分解， 故不能與鹼性農藥混用， 這些藥劑不宜與鹼性的石硫合劑、波爾多液混用。 (但殺蟎劑尼索朗具有能與鹼性藥劑混用的優點， 則不在其列)大多數有機硫殺菌劑對酸性反應比較敏感， 混用時要慎重。 如：雙效靈(即氨基酸銅)遇酸就會分解析出銅離子， 不僅降低藥效， 而且很容易產生藥害。 一些農藥不能和含金屬離子的藥物混用， 如：甲基托布津、二硫化氨基甲酸鹽類殺菌劑等不宜與銅製劑混用。
混用後產生藥害的不能混用
石硫合劑和波爾多液混用;二硫代氨基甲酸鹽類殺菌劑與銅製劑混用;福美雙、代森環類殺菌劑和鹼性藥物混用， 都會生成對作物產生嚴重藥害的物質， 因此不能混用。
具有交互抗性的農藥不宜混用
如殺菌劑多菌靈、甲基托布津具有交互抗性。 混合用不但不能起到延緩病菌產生抗藥性的作用， 反而會加速抗藥性的產生， 所以不能混用。
物理性狀被改變的不能混用