根據損傷影響到肝內膽管還是肝外膽管， 膽汁淤積性肝病可以分為兩大類， 肝內膽管淤積或肝外膽管淤積。 區分二者最簡單的診斷試驗是肝臟超聲。 肝臟超聲可以很好的鑒別出肝外膽管淤積。 因此， 膽汁淤積性肝損傷的鑒別診斷應該從肝臟超聲開始， 用以鑒別肝內膽管淤積和肝外膽管淤積。
ALP升高的診斷流程
膽汁鬱積性肝病的原因
病毒性肝炎病毒性肝炎是最常見的導致肝細胞損傷（即AST和ALT升高占主導地位）的肝臟疾病原因。 然在， 病毒性肝炎在極少數情況下導致膽汁淤積性肝損傷。
自身免疫性肝病自身免疫性肝病的三種最常見的形式為自身免疫性肝炎、原發性膽汁性膽管炎（PBC）和原發性硬化性膽管炎（PSC）。
自身免疫性肝炎的特點是血清ALT和AST水準較高， 而原發性膽汁性膽管炎和原發性硬化性膽管炎為膽汁淤積性疾病， 因此與鹼性磷酸酶（ALP）的顯著升高相關。
原發性膽汁性膽管炎（和自身免疫性肝炎）與血清中的自身抗體相關， 如抗核抗體， 平滑肌抗體和抗線粒體抗體。
原發性硬化性膽管炎通常影響肝外膽道系統。 此外， 原發性硬化性膽管炎與炎症性腸病， 尤其是潰瘍性結腸炎相關。
藥物性肝損傷藥物性肝損傷是膽汁淤積性肝病的常見原因。 服用各類處方或非處方藥、生物製劑、傳統中藥、保健品（HP）、膳食補充劑及其代謝產物有可能發生藥物性肝損傷。
浸潤性疾病在膽汁淤積性肝病的鑒別診斷中應考慮浸潤性疾病如澱粉樣變性、結節病或淋巴瘤等。 提示浸潤過程的一個線索是鹼性磷酸酶的水準顯著升高，