陸軍有師團營連的等級， 在一艘艦艇上， 也有這樣的對應劃分， 將艦上人員編為幾個大的部門。 海自艦艇將部門稱為科， 這與岸基指揮機構科室稱呼一致， 科最高領導為XX長。
這是日本餘手級登陸艇， 排水量420噸， 主要用於離島的運輸補給， 日方稱之為“輸送艇”， 倒也恰如其分。 這型艇的部門分別有：船務科、機電科、運用科、補給科， 合計4個科。 其中， 船務科最雜， 有航海、通信、雷達等專業。
這是燧灘級多用途支援艦， 排水量950噸， 主要用於訓練保障， 現役有5艘， 舷號分別是AMS4301-05， 這型艦的科設置有：船務科、航海科、補給科、機電科、運用科， 合計5個科。 其中， 航海單獨列為一個科。
這是海自碎冰艦白瀨號（二代）， 海自唯一一艘現役碎冰艦， 排水量5000噸。 這型艦的科設置有：航海科、船務科、運用科、機電科、衛生科、飛行科、補給科， 合計7個科。 其中， 多了一個特別的衛生科， 主要針對北極科考任務而設置的。
綜上，機電科、運用科、補給科必不可少，運用科主要負責艦上武備；大中型艦船航海、船務科分開，有直升機的設置有飛行科。由此推測，海自遠洋補給艦科分為：航海科、船務科、運用科、補給科、機電科、醫務科、飛行科，同破冰艦相似。此外，水雷戰艦艇編有水雷科。
那麼，作為海自主力的驅逐艦是如何分科的呢？航海科、船務科、機電科、飛行科自不可少，從公開資料看，驅逐艦上設有炮雷長、應急長、醫務長，說明驅逐艦上還設有炮雷科、應急科、醫務科。就是繁多電子設備是放在船務科，還是另編為一個科？從燧灘級支援艦看，船務科有電測員，這就是雷達手（相應的聲納手，海自稱作水測手），電子設備放在船務科可能性極大。
日向號兩栖攻擊艦指揮中心
此外，還有個疑點就是，上述三型輔助艦艇都編有補給科，登陸艇還好理解，支援艦設置補給科則似乎不合常理。從海自將後勤人員分為經理員、補給員、給養員看，這個補給科不同於補給艦的“補給科”，應是負責艦上各項後勤事務的科。
海自補給科給養員在加工咖喱飯
由此，基本可以判定，海自驅逐艦編有航海科、船務科、炮雷科、機電科、應急科、飛行科、醫務科、補給科，合計8科。航海科主要負責航海保障，船務科負責通信、雷達，炮雷科負責武備（小型艦船為運用科），機電科負責動力，應急科負責損害管制（小型艦船機電科兼），飛行科負責直升機飛行保障，補給科負責所以物資保障。
這其中，最有意思的是負責損管的應急科。損管有艦艇“第二生命”之稱，二戰中舊日本海軍的損管表現，被認為遠遜於美軍。痛定思痛，戰後，海自一方面獲得了世界第一的掃雷能力，在艦上設置應急科，也可能與此痛徹心扉的體驗有關。
前幾年，海自艦艇頻發火災、碰撞等事故，雖然有人員傷亡，倒沒有步阿三後塵，匯出自己擊沉自己的烏龍。這其中，海自比阿三優越的損管能力，起到了核心作用。
綜上，機電科、運用科、補給科必不可少，運用科主要負責艦上武備；大中型艦船航海、船務科分開，有直升機的設置有飛行科。由此推測，海自遠洋補給艦科分為：航海科、船務科、運用科、補給科、機電科、醫務科、飛行科，同破冰艦相似。此外，水雷戰艦艇編有水雷科。
那麼，作為海自主力的驅逐艦是如何分科的呢？航海科、船務科、機電科、飛行科自不可少，從公開資料看，驅逐艦上設有炮雷長、應急長、醫務長，說明驅逐艦上還設有炮雷科、應急科、醫務科。就是繁多電子設備是放在船務科，還是另編為一個科？從燧灘級支援艦看，船務科有電測員，這就是雷達手（相應的聲納手，海自稱作水測手），電子設備放在船務科可能性極大。
日向號兩栖攻擊艦指揮中心
此外，還有個疑點就是，上述三型輔助艦艇都編有補給科，登陸艇還好理解，支援艦設置補給科則似乎不合常理。從海自將後勤人員分為經理員、補給員、給養員看，這個補給科不同於補給艦的“補給科”，應是負責艦上各項後勤事務的科。
海自補給科給養員在加工咖喱飯
由此，基本可以判定，海自驅逐艦編有航海科、船務科、炮雷科、機電科、應急科、飛行科、醫務科、補給科，合計8科。航海科主要負責航海保障，船務科負責通信、雷達，炮雷科負責武備（小型艦船為運用科），機電科負責動力，應急科負責損害管制（小型艦船機電科兼），飛行科負責直升機飛行保障，補給科負責所以物資保障。
這其中，最有意思的是負責損管的應急科。損管有艦艇“第二生命”之稱，二戰中舊日本海軍的損管表現，被認為遠遜於美軍。痛定思痛，戰後，海自一方面獲得了世界第一的掃雷能力，在艦上設置應急科，也可能與此痛徹心扉的體驗有關。
前幾年，海自艦艇頻發火災、碰撞等事故，雖然有人員傷亡，倒沒有步阿三後塵，匯出自己擊沉自己的烏龍。這其中，海自比阿三優越的損管能力，起到了核心作用。