由於腫瘤巨大的遺傳多樣性， 開發癌症疫苗往往是一個令人望而生畏的課題。 為了調查通用型癌症疫苗的可行性， 羅氏製藥的研究團隊分析了63,000多個腫瘤的基因組譜， 這項研究於2月24日線上發表在《Genome Medicine》期刊上。 日前， 這篇文章的第一作者、Foundation Medicine的研究員Ryan Hartmaier在其博客裡對他們的發現進行了詳細的解讀。
腫瘤間的遺傳多樣性使通用型癌症疫苗的開發很困難
從根本上說， 癌症是由基因突變驅動的基因疾病。 確定特定癌症的基因組譜對尋找最有效的治療方法是非常有效的。 最近的研究進展表明， 我們或可使用基因組資訊來調節免疫系統以對抗癌症。
我們的免疫系統能夠非常有效地識別和清除外來的病原體， 如細菌和病毒。 這種能力源於其將外源病原體蛋白片段區分為“異己”的能力。 這些“異己”物質就是我們所謂的抗原。 免疫系統能夠調動各種攻擊措施和防禦能力來對付特定的病原體。 通常情況下， 我們可以使用疫苗來説明免疫系統產生更強烈的反應。
與之相似的是， 我們現在知道腫瘤內的突變可以被免疫系統識別。 由於它們僅在癌細胞中被發現， 因此被稱為新抗原（neoantigens）。 就像疫苗對傳統病原體（如脊髓灰質炎和流感）有效一樣， 科學家們希望針對這些新抗原的疫苗能給癌症患者帶來更多治療的益處。
但是由於多種原因，
通用型癌症疫苗只能使小於1%的癌症患者群體受益
為了分析腫瘤的遺傳多樣性和評估通用型癌症疫苗的可行性， 研究者分析了超過63,000個腫瘤的基因組譜， 它表明每個腫瘤通常包含一組獨特的突變。
在這種廣泛多樣性的背景下， 研究人員挑選出10種新抗原突變， 並使更多的腫瘤（約25%）至少包含其中一個新抗原突變。
但我們知道， 並不是所有的突變都能被免疫系統識別。 因此， 研究者應用最先進的演算法， 預測哪些突變可以被免疫系統識別。 在最佳方案的分析中， 研究表明通用型癌症疫苗的方法是可行的， 但只有小於1%的癌症患者群體能受益。
這種分析提供了寶貴的資料來説明指導癌症疫苗的開發工作， 雖然仍具有某些局限性， 但它提供了強有力的證據， 表明癌症疫苗和其他靶向免疫療法可能需要依賴於個體化的方法， 來使絕大多數癌症患者受益。
參考文獻：
Genomic analysis of 63,220 tumors revealsinsights into tumor uniqueness and targeted cancer immunotherapy strategies.DOI: 10.1186/s13073-017-0408-2
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