在澆水過程中要掌握“三澆三不澆三控”原則， 即陰天不澆晴天澆、下午不澆上午澆、明水不澆暗水澆；苗期要控制澆水、連陰天控制澆水、低溫控制澆水。
一般8～9點澆水， 澆水後必須密閉棚室增溫2小時左右， 當溫度提高到35℃時， 再由小到大逐漸放風排濕， 以減少夜間結露。
澆水之前一定要看天氣預報， 絕對不允許在出現雨雪天或連陰天前澆水。 番茄定植時一般要澆足底水， 等緩苗後澆一次緩苗水，
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當第一穗果坐作後結合澆水進行追肥， 以後， 每坐住一層果都要追一次肥， 用肥種類要認真選擇， 氮、磷、鉀比例、數量合理搭配。 第一次追肥時， 如果底肥充足， 量不宜大甚至不施， 每畝施尿素或硝酸銨15～20kg， 過磷酸鈣15kg， 隨水沖施。 以後每隔7～10天施一次， 每次追施磷酸二銨20kg， 或氮、磷、鉀複合肥20～25kg， 過磷酸鈣15kg， 肥料應輪換使用， 有機肥和化肥交替使用。 拉秧前20天不再追肥。
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另外， 結果期可葉面噴施0.2%～0.3%的磷酸二氫鉀， 不僅能提高坐果率， 而且能促使果實膨大。 臍腐病發生嚴重的溫室應注意鈣肥的使用， 在結果初期可噴施1%的過磷酸鈣或0.5%的氯化鈣， 進行葉面追肥， 防止臍腐病的大量發生。
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