近年來消毒藥的正確使用已經成為世界各國普遍關注的問題。 隨著大規模畜禽養殖業的發展， 不斷出現一些高效、光譜、低毒、刺激性和腐蝕性小的新型消毒劑。 過去很多認為低毒， 副作用小的消毒劑， 近年來發現在一定條件下他們依然有相當強的毒副作用。 所以， 究竟要選擇一些什麼樣的藥物， 減少因為消毒對動物和人自身的傷害， 使養殖經濟效益最大化呢？
環境消毒（養殖場大環境）：
苯酚：臨床上常常調製成複合酚， 複合酚能殺滅細菌、黴菌、病毒， 也可以殺滅寄生蟲卵， 甚至能殺死讓人畏懼的炭疽芽孢， 所以這個消毒劑很厲害吧， 這種消毒劑最適合作為新養殖場消毒， 也非常適合全進全出的養殖場消毒。 但是複合酚具有麻醉作用， 使用時一定注意不能碰到皮膚和粘膜。
戊二醛：這個也是筆者比較喜歡用的一種消毒劑， 消毒效果略微比複合酚弱，
氫氧化鈉：也叫火堿， 燒鹼， 對於豬瘟， 口蹄疫豬丹毒， 豬流感， 雞白莉消毒效果特別好。
氧化鈣：也就是生石灰， 最便宜實惠的消毒藥。 用於潮濕地面， 糞池周圍， 污水溝的消毒， 也可以用於無害化處理消毒。
二氯異氰尿酸鈉：可以用於飲水消毒， 也可以用於薰蒸消毒， 點燃以後產生白色煙霧， 對於密閉性圈舍， 立體空間大德圈舍比較好用。 但是注意不要吸入煙霧， 容易中毒。
過氧乙酸：能殺死細菌病毒和芽孢， 低溫下也有很好的消毒效果， 適合冬季使用， 可以用於器具消毒。
皮膚和粘膜消毒藥：
乙醇：也就是酒精， 醫用酒精濃度應不低於75%， 可以用於器械和輸液注射， 手術時的消毒。
聚維酮碘：一種高效低毒的消毒劑， 對細菌， 芽孢， 病毒都有很好的殺滅作用， 筆者在養豬場上班的時候最喜歡用的消毒劑之一， 該消毒劑用於牧畜助產最佳， 消毒手臂， 器械， 創口。
過氧化氫：雙氧水， 也就是有兩個氧分子的水， 哈哈。 殺菌能力弱， 但是適合清洗創口， 去除疤皮， 還有一定的除臭和止血作用。
高錳酸鉀：具有殺菌， 除臭， 解毒的作用。 誤食用會引起消化道異常代謝。