錦鯉生理很重要的一點就是透過鰓來排泄含氮廢物， 以擴散作用的方式來排放。 而當濃度高於錦鯉體內的濃度時， 含氮廢物便經由鰓部由水中擴散至錦鯉體內。
當錦鯉體內的含氮廢物高至某種濃度時便會對細胞造成毒性， 於是這時候錦鯉為了要生存， 鰓部細胞就需要消耗大量的能量叫做細胞的主動運輸， 將擴散進來的含氮廢物送出錦鯉體， 如此這般又造成了兩個問題：
1、喂飼料所產生的能量原本希望錦鯉只用來成長， 但因為水質的不好， 錦鯉只好將能量用來抵抗含氮廢物由外而內的擴散而不會成長了。
2、當含氮廢物達到一個濃度後， 錦鯉不會再進食， 不再有能量供給錦鯉只， 錦鯉只能靠以往儲存在錦鯉體內的能量來抵抗外來的含氮廢物， 最後當能量用完時， 外界的含氮廢物便一舉入侵， 破壞錦鯉體細胞， 剛開始小部分的細胞中毒，
當水質不好， 錦鯉只不再進食時， 如果主人還拼命丟飼料， 而飼料的能量非但無法提供給錦鯉， 反而供給水中的細菌充分的成長能量， 不論好的壞的細菌都大量繁殖， 細菌大量繁殖的結果造成水中氧氣的缺乏及有害細菌感染錦鯉， 造成錦鯉既缺氧又生病， 加速錦鯉的死亡。
綜上所述， 飼養錦鯉要注意預防：
1. 不能餵食過多， 所謂養生七分飽就行， 避免錦鯉排泄物過多；
2. 採用強大過濾， 及時過濾水質， 定期清洗過濾系統， 加入新水；
3. 注意觀察錦鯉狀態、水質顏色變化， 魚吃料突然下降， 停喂1天；