慢性細菌性前列腺炎是由於細菌感染導致的前列腺的慢性炎症，也有是由於急性前列腺炎遷延而形成的。由於慢性前列腺炎治療困難，所以需要綜合治療。
增強機體免疫力
服用中藥，適量運動增強機體免疫力。由於運動後改善了血液循環系統、呼吸系統功能。全身的血液循環系統得到改善後，盆腔血液回流通暢，降低盆腔慢性充血的可能性出現。15 分鐘左右的仰臥起坐對改善盆腔血液迴圈也很有好處。運動可以選擇慢跑、游泳、騎車、健身操等有氧運動。有氧運動要持之以恆，堅持每天運動，每次運動至少15分鐘，最好是30～60分鐘的運動時間。不能每天堅持的也應至少不低於每週4 次運動時間。循序漸進，開始時運動量不要過大，只要有呼吸急促、心率加快的感覺就可以了，並在日後漸漸加大運動量。
改善前列腺血液迴圈
前列腺按摩使得前列腺引流通暢。定期前列腺按摩可以讓前列腺液排空，避免前列腺液內積聚太多的病原體。按摩一般需要定期到醫院由醫生進行。
前列腺局部物理治療如經尿道微波治療、經直腸物理治療等等。溫熱水坐盆或盆浴，也通過溫水的物理刺激，改善前列腺的局部血液迴圈。
尿道擴張
對尿道狹窄或不通暢者定期尿道擴張以利排泄，且在探條通過尿道時，可拉長前列腺開口，有利於腺體引流。
藥物灌注
經尿道插入特製的氣囊尿管，向前列腺尿道部注入無菌生理鹽水並抽吸數次，吸淨膿性分泌物，再注入抗菌素，每週一次。
抗菌藥物
一般的抗菌藥物不易進入前列腺組織，這也是臨床上治療較為困難的原因之一。可2～3種聯合應用，或根據前列腺液培養及藥物敏感試驗結果選擇性應用。
一般只要經過上述的多種方法的治療3～6個月，前列腺炎可以得到有效的治療。