對前列腺炎，尤其是慢性前列腺炎的治療仍然有許多問題沒有澄清。許多患者都認為選擇敏感的抗生素是治療前列腺炎必要手段，尤其是藥物的局部治療。但是單純使用抗生素常不能獲得滿意效果，尤其是對反復多次復發的慢性前列腺炎患者效果更差，即使是對肯定存在感染因素的細菌性前列腺炎也是如此。
應用解除肌肉痙攣的藥物或方法，例如儀一腎上腺素能受體(at.-AR）阻滯劑YB受體阻滯劑、平滑肌鬆弛劑、生物回饋方法、植物藥療法等，常可較好地緩解局部疼痛和排尿異常症狀。還應該重視綜合治療措施，強調精神心理治療、矯治神經衰弱，普及防治前列腺疾病的常識。
由於單一的治療方法往往造成治療週期延長、多數治療失敗、患者的自信心和對醫生的信任度下降，所以一般都同時選擇多種療法的綜合治療措施，從不同的角度，根據不同的發病環節進行針對性治療。在治療過程中，患者要定期到醫院複查或讓醫生定期隨訪，根據病情變化採取相應的措施。同時患者應該瞭解本病的預後，使其能夠對自身疾病及其轉歸有一個清醒的認識。如何保護前列腺是前列腺炎患者在治療過程中和疾病治癒後始終要注意的重要問題，儘量避免一切對前列腺有害的因素，幫助前列腺炎患者康復並防止復發或再感染。
目前，臨床上治療前列腺炎的方法選擇和藥物選擇很多，還沒有哪一種方法或藥物可以明顯有效地適用於所有的前列腺炎患者。即使醫生十分肯定前列腺炎患者的病因，例如免疫性異常、神經肌肉緊張等，也不能治癒所有的患者或使患者的所有的臨床症狀完全消失。深入研究前列腺炎的病因和病理生理，可望選擇出針對不同病因或不同類型前列炎更加有效的治療方法，制定出詳細全面的治療規範，治療前列腺炎的混亂狀態才會徹底得以糾正。