發生於顱底的惡性腫瘤，因被惡性腫瘤侵蝕破壞了顱底骨質，且腫瘤向顱內生長蔓延而侵蝕了三叉神經，引起三叉神經痛，出現顏面部三叉神經分佈區域疼痛發作。常見的惡性腫瘤有：鼻咽癌、顱底部異位性惡性腫瘤。此惡性腫瘤多發生於中老年人。
鼻咽癌及顱底異位性腫瘤的位置往往比較隱蔽，檢查時不易被發現，早期易被漏診和誤診。鼻咽部隱窩的上方即為破裂孔，它們相距約1釐米，故腫瘤可經此孔而侵入顱內。第V及第Ⅵ六對腦神經受侵犯後，產生劇烈頭痛，或受累側三叉神經劇痛，早期為間歇性痛，並常見於三叉神經第一支受累者，晚期多為持續性劇痛，而部位不固定;第六對腦神經受侵犯後，產生眼外直肌癱瘓等症狀和體征。若腫瘤繼續發展，則進顱中窩，壓迫神經而出現第Ⅲ、Ⅱ對腦神經受累的症狀和體征。遇上述情況者，應仔細檢查鼻咽部。對可疑病例應及時取活組織檢查，必要時行反復多次檢查。X線顱底拍片及CT檢查顯示有顱底占位元性病變者，應考慮到顱底惡性腫瘤。