《醫宗金鑒·外科心法要訣》中說：“肛門圍繞，折紋破裂，便結者，火燥也。”扼要闡述了因熱結腸燥，或因陰虛津虧而致大便秘結，排便用力，使肛門皮膚裂傷，隨後又繼發感染，逐漸形成慢性、梭形潰瘍。但也有因肛管狹窄、肛門濕疹、痔瘡損傷等感染而發病。
1、解剖學因素：肛門外括約肌淺部，從尾骨起，向前至肛門後方。肛門前、後方不如兩側牢固，容易受損傷。因此，肛門後部受糞便壓迫較重，又因肛管後部血液迴圈不足，彈性較差，肛門腺分佈又較多，這些都是發生肛裂的因素。
2、外傷學說：幹硬的糞便或異物容易引起肛管皮膚的損傷，這是引起肛裂的主要因素。
3、感染學說：主要是肛門後部的肛隱窩感染，炎症向肛管皮下部蔓延，致使皮下膿腫破潰而成肛裂。
4、內括約肌痙攣學說：由於肛管部位損傷或炎症刺激，使肛門括約肌處於痙攣狀態，致使肛管張力增強，易損傷成肛裂。
5、肛門狹小學說：肛管皮膚在發育中遲緩，生成肛管狹小，易損傷成肛裂。