中醫學對於肝癌的病因，醫家所論多為外感六淫邪毒，飲食失調，或情志鬱結，或正氣不足，臟腑失和，氣機阻滯，痰濁內生，淤血內停，日積月累而成。
肝癌病因不完全明瞭，但被認為與乙型和丙型肝炎、肝硬化、中華分支睾吸蟲、遺傳因素、某些微量元素缺乏、攝入黃麴黴素、攝入亞硝胺類等化學物質有較為密切的聯繫。
1.情志因素
因情志不舒，喜怒失常，憂愁和暴怒等精神情緒變化，導致氣機不暢，血行受阻，日積月累而見臟腑功能失調，抵抗力減弱。在營養缺乏，或飲食不節，或寒溫不適，或嗜酒過度，或邪毒外侵等因素誘發下而發病。
2.外邪入侵
濕熱等六淫之邪留滯經脈，聚於臟腑，致使氣滯血淤，或氣血失調，或肝腎陰虛，日久而成。也有學者認為局部癌腫是熱毒、積滯、淤血、痰飲等在一定條件下相互聚結而成。其病機則是“因病致虛”。即患者雖可同時具有邪毒積聚和氣血虛弱的表現，但其病因病機的基礎是外邪入侵。
3.正氣虛弱
正氣虛是腫瘤發生的重要因素，正虛由於程度和階段不同，可能有顯露和隱蔽的二種情況存在，再加上外感六淫疫毒，飲食失調，七情內傷，臟腑虛損，氣血失和等因素而引發。
總之，對原發性肝癌的病因病機除了反映該病的多因素病因和複雜的病機外，其共性可能仍為歷代醫家所描述的體內的“正氣不足”和外來的“邪氣滯留”有關。肝癌的發生是由正虛和邪實共存，內因和外因相互作用而產生的病理產物。從病機上看，本病是一種因虛致病，因病致虛，本虛標實的疾病。故臨床上出現全身表現為虛，局部表現為實的現象。