肝癌的治療方法分為手術類與非手術類兩大類。手術治療包括肝臟切除和肝移植。非手術治療包括放化療，分子靶向治療，中醫治療，生物治療等等。每個方法都有各自的特點與療效。綜合療法並不是各種方法的疊加，而是根據每個不同的病人來具體分配。現在的醫學的研究發現，靶向藥物在肝癌的治療上效果還是非常的好，這也是生物技術上的一個發展。靶向藥物可以以癌細胞為靶點，直接抑制或殺死癌細胞。肝癌的靶向藥物也非常的多，包括索拉菲尼、貝伐單抗等。
1、索拉非尼
索拉菲尼作為第一個在肝癌治療上應用的靶向藥物。索拉非尼是一種小分子多靶點生物靶向治療新藥腫瘤的生存、生長和轉移依賴於腫瘤細胞增殖和腫瘤血管形成,索拉非尼一方面可通過抑制 RAS/ RAF/ MEK/ ERK 信號傳導通路直接抑制腫瘤細胞增殖，另一方面通過抑制幾種與新生血管生成和腫瘤發展有關的酪氨酸激酶受體活性,包括血管內皮生長因數受體-2、血小板衍生的生長因數受體等阻斷腫瘤新生血管生成,間接抑制腫瘤細胞的生長，從而起到抗腫瘤作用。肝癌是一種伴VEGF 高表達的最堅實的血管腫瘤，因此索拉非尼抑制血管生成的作用可能對肝癌更加顯著。
2、舒尼替尼
舒尼替尼。舒尼替尼是一個多靶點作用的酪氨酸激酶受體小分子抑制劑，靶點包括PDGF-α、PDGF-β、VEGFR-1、VEG-FR-2、VEGFR-3、KIT、 FLT-3、集落刺激因數收體1型和RET，通過干擾信號傳導，達到抑制腫瘤細胞分裂和生長的作用。
3、厄羅替尼
是一種口服的小分子EGFR 抑制劑，針對酪氨酸激酶區域。針對肝癌的使用上並不是很多。
4、西妥昔單抗
是一種單克隆抗體，針對EGFR，如同貝伐單抗一樣,它已成為很多晚期、原癌基因野生型結直腸癌患者的標準療法的重要組成部分。與厄羅替尼不同，其對肝癌治療是否有效尚缺乏有力證據。
5、依維莫司
是mTOR的另一種抑制劑, 已被證明對肝癌異種移植有作用。有研究顯示，依維莫司聯合索拉非尼治療HCC的早期結果令人滿意。