種肥 為避免肥料燒傷種子，種肥的施用深度以5～6釐米為宜，種肥與種子的水準距離（側距）應適當，一般為3～5釐米。
追肥 施追肥時中藥材根系已初步形成，如採用機械追肥，應儘量減少傷根，施肥不宜太深，側距應適當。一般情況下，行間追肥，適宜窄行栽培的中藥材如薏苡、車前子等的追肥深度以6～8釐米為宜，側距以10～15釐米為宜；適宜寬行栽培的中藥材如金銀花、黃梔子等的追肥深度以8～12釐米為宜，側距以10～15釐米為宜。
底肥 底肥的施用深度為15～20釐米或更深。可先將肥料撒施於地表再用犁耕翻入土，也可在犁耕作業的同時將肥料施入犁溝內。