雖然放療用於子宮內膜異位症已有多年歷史，但應用多種藥物及手術達到很高療效，一般不破壞卵巢功能，而放射治療子宮內膜異位症的作用，在於破壞卵巢組織，從而消除卵巢激素的影響，使異位的內膜萎縮，達到治療的目的。放射線對異位的內膜破壞作用並不明顯，但對既不能耐受激素治療又因病灶位於腸道、泌尿道及廣泛盆腔粘連，尤其是合併心、肺或腎等嚴重疾病，本人又十分懼怕手術的個別患者，也可採用體外放療，破壞卵巢功能，達到治療目的。即便個別接受放療者，必須先明確診斷，特別是不能將惡性卵巢腫瘤誤診為子宮內膜囊腫，以至錯治而延誤正確治療。
根據目前公認的病因，注意下列幾點，可能預防子宮內膜異位症的發生。
一、避免在臨近月經期進行不必要的、重複的或過於粗暴的婦科雙合診，以免將子宮內膜擠入輸卵管，引起腹腔種植。
二、婦科手術儘量避免接近經期施行。必須進行時，術中操作要輕柔，避免用力擠壓宮體，否則有可能將內膜擠入輸卵管、腹腔。
三、及時矯正過度後屈子宮及宮頸管狹窄，使經血引流通暢，避免淤滯，引起倒流。
四、嚴格掌握輸卵管通暢試驗