隨著大腸癌發病率的逐年增加，各種新技術、新療法不斷出現。然而，就目前狀況來看，手術仍是治療大腸癌最有效的方法。大腸癌手術的基本原則與腫瘤手術的基本原則一致，概括起來說，就是根治性、安全性、功能性三性原則。
大腸癌的手術方式：.局部切除術：局部切除術指腫瘤所在區域的部分腸壁切除，適於局限於黏膜或黏膜肌層的早期淺表型結腸癌及良性腫瘤。部分位於黏膜肌層和位於黏膜下層的惡性腫瘤，其中少數病例可能已存在區域淋巴結微轉移和轉移，僅作局部切除術可能達不到根治要求，此類病例應審慎採用局部切除術。局部切除術切除範圍可包括腸壁全層，切緣距腫瘤。亦可以經內鏡作黏膜切除，或經擴肛行黏膜層、黏膜下層和部分肌層的切除。.腸段切除術：腸段切除術指切除包括腫瘤在內的一定長度的腸管，一般要求上、下切緣距腫瘤，腫瘤腸段切除應包括相應的系膜切除，即達到DL的要求。適用於較大的良性腫瘤以及部分限於黏膜下、淺肌層且無淋巴結轉移的癌腫。.根治術：根治術或絕對根治術是指手術徹底切除腫瘤並清除區域淋巴結，而組織學檢查的各個切緣均無癌殘留者。.聯合臟器切除術：結腸癌聯合臟器切除術適用於鄰近臟器受侵的病例，常作為根治性術式應用。但在某些情況下，如癌瘤侵及其他臟器，可能出現梗阻或穿孔，或已形成內瘺，且術後生存預期較長者，即使已發生遠處播散，仍可行姑息性聯合臟器切除術。E.姑息性腫瘤切除術：絕對姑息性腫瘤切除術，指肉眼見有腫瘤殘留者。如已存在腹膜、肝及非區域性的遠處淋巴結的轉移，無法行全部轉移灶切除的情況。相對姑息性腫瘤切除術或相對根治術，雖為根治性術式，術中肉眼判斷腫瘤亦已切除殆盡，但術後組織學證實有切緣、腫瘤基底殘留或清除的最高一級淋巴結已有轉移者。
根據治療的性質和目的，放射治療可分為根治性放射治療和姑息性放射治療。術前放療在直腸癌綜合治療中的地位已逐步得到肯定。
因此如何預防和治療局部復發仍是大腸癌研究的重點。目前，雖然對術後放療的療效各家報導還不一致，但直腸癌手術後聯合放化療仍是標準的輔助治療方法。 一般認為，術後放療開始早者效果較好，以在術後2個月內開始為好。Ⅰ期病人由於術後局部復發率較低，故無必要再加用放療。Ⅱ、Ⅲ期病人，尤其是病灶外侵明顯、有較多的區域淋巴結轉移、手術有局部殘留者，常需作術後放療。
近年，由於認為前後治療間隔時間較長，缺乏完整性，且放射劑量不易掌握，此方法有應用減少的趨勢。鱗癌對放化療均較為敏感，化療藥物中如5-FU、絲裂黴素及順鉑等已被證實有放射增敏作用。鑒於此，目前在歐美國家“放化療”已成為肛管鱗癌的首選治療方式，並已取得了良好的療效。
一組隨機試驗的結果認為術前放療的手術死亡率及併發症都等於零。如果放療時能夠充分地遵守分次、分割劑量、劑量一體積效應等放射生物學的基本原則，術前放療幾乎不會有併發症，同時也不會由於術前放療而增加手術後患者的併發症。術後放療可使會陰部瘢痕硬化或有輕度的小腸炎、膀胱炎，對症處理後一般均可緩解。
大腸癌根治術後，患者發生單一部位的復發轉移腫瘤、且有再次根治切除的可能。局部復發灶應視病變累及的範圍選擇是否再次手術以及決定手術的方式和範圍。肝轉移的病人如除肝以外無其他部位復發或轉移，肺轉移的病人如除肺以外無其他部位復發或轉移，則視轉移灶的數目和範圍決定能否手術，並加用化療等綜合治療。一般情況。因此隨訪中發現肝和肺轉移癌也應視情況爭取手術切除。對無法切除者如化療後有效，部分病人可能仍可獲切除機會而治癒。
肝臟是大腸癌最常見的轉移灶僅限於肝臟。雖然以往的文獻報導肝轉移發生後預後很差，肺轉移的治療
肺也是大腸癌腹腔外轉移最常見的部位之一，在全部大腸癌中。肺轉移常伴有全身轉移。X線檢查對肺轉移的診斷可提供有價值的資料，CT檢查可正確估計肺部病變的數量和位置，纖維支氣管鏡檢毛刷或針吸活檢則可明確病理類型，痰細胞學檢查也可提供參考，但陽性率較低。