乙肝病毒是引發人類急、慢性乙型病毒性肝炎的病毒，屬於嗜肝DNA病毒科。HBV基因組又稱為HBVDNA，其結構獨特而精密，由不完全的環狀雙鏈DNA組成，長的為負鏈，短的為正鏈。負鏈含3200個堿基，正鏈的長度可變。HBV基因組中4個開放讀碼框均位於負鏈，分別為S區、C區、P區、X區。
HBV的基因組易突變，大部分突變為沉默突變，無生物學意義，但某些關鍵位點的突變可引起表面抗原亞型改變或HBsAg陰性乙型肝炎，可引起e抗原陰性/e抗體陽性乙型肝炎，可致核心抗體陰性乙型肝炎，可導致複製缺陷或複製水準的降低。HBV基因組變異除了影響血清學指標的檢測外，可能還與疫苗接種失敗、肝炎慢性化、重型肝炎或肝細胞癌等情況的發生有關，需要引起注意。