乙型肝炎病毒是一種嗜肝病毒，主要存在於肝細胞內並損害肝細胞，引起肝細胞炎症、壞死、纖維化。病原學上乙型肝炎病毒的感染過程如下：
乙型肝炎病毒侵入人體後，首先與肝細胞膜上的受體結合，脫去包膜，穿入肝細胞質內，然後脫去衣殼，部分雙鏈環狀HBVDNA進入肝細胞核內，在宿主酶的作用下，以負鏈DNA為範本延長正鏈，修補正鏈中的裂隙區，形成共價閉合環狀DNA。
然後以共價閉合環狀DNA為範本，在宿主RNA聚合酶II的作用下，轉錄成幾種不同長短的mRNA，其中3.5kb的mRNA含有HBVDNA序列上全部遺傳信息，稱為前基因組RNA。
前基因組RNA進入肝細胞質作為範本，在HBV逆轉錄酶作用下，合成負鏈DNA；再以負鏈DNA為範本，在HBVDNA聚合酶作用下，合成正鏈DNA，形成子代的部分雙鏈環狀DNA， 最後裝配成完整的HBV，釋放至肝細胞外。胞質中的子代部分雙鏈環狀DNA 也可進入肝細胞核內，再形成共價閉合環狀DNA並繼續複製。共價閉合環狀DNA半壽 期長，很難從體內徹底清除。