紅斑狼瘡臨床上講是可以完全控制，當然也有可能反復發作。目前治療紅斑狼瘡的首選還是藥物為主，其它的治療為輔，藥物治療主要就是激素和免疫製劑，要根據不同病情進行選擇。
系統性紅斑狼瘡的治療常用藥物：
1、非甾體類抗炎藥
如阿司匹林、消炎痛、芬必得等。常用於治療輕症的SLE，副作用較多，有些副作用易與SLE表現相混淆，但有的損害是可逆的。
2、抗瘧藥
氯喹、羥氯喹等。廣泛用於控制全身症狀、皮疹、肌肉、關節等表現。一般耐受性良好，主要副作用是眼毒性;治療前及治療後每三個月，應檢查一次眼底。
3、糖皮質激素
是治療SLE的最主要的藥物，副作用多。以潑尼松最為常用。其使用劑量為50mg/d為大劑量。急性、活動期，可分次服用;穩定後可1次/d。潑尼松5～20mg/d，口服，可有效治療全身症狀、皮膚損害、漿膜炎及關節、肌肉損害等。對嚴重表現者，如腎炎、腦病、血管炎、血液系統損害及肺損害等，常用大劑量潑尼松或用甲基潑尼松龍0.5～1.0g/d，靜脈滴注，連續衝擊三天;衝擊後，以潑尼松60～80mg/d，口服維持。病情穩定後，依情減量，維持治療。
4、免疫抑制劑
如環磷醯胺、硫唑嘌呤、氨甲蝶呤、cellcept、酞胺呱啶酮、環孢素A等。主要用於嚴重病例、重要器官受累或需大劑量糖皮質激素控制病情而不能耐受減量者。CTX最常用，靜脈用藥優於口服。對LN患者，給予潑尼松口服，合併靜脈間斷CTX衝擊治療，其療效較單用某一種藥物更佳。CTX對SLE的血液系統損害、血管炎、狼瘡腦病等亦有很好療效。CTX的使用劑量為：衝擊治療，0.5～1.0/m2·次，1次/1～3個月，靜脈滴注滴。硫唑嘌呤的使用劑量為1～2.5mg/kg·d，口服。
cellcept在體內的降解產物可選擇性地、可逆地抑制次黃嘌呤單磷酸脫氫酶，從而阻斷鳥苷酸合成，進而抑制T、B淋巴細胞的增殖反應。該藥在國內外用於SLE試驗治療，已取得較好療效。
酞胺呱啶酮，沙立度胺，反應停可促進mRNA降解，啟動單核-巨噬細胞，抑制粒細胞活性，減少TNF-α的產生;可用於治療SLE的頑固性皮膚損害。CsA是具有免疫調節及免疫抑制作用的新藥，可用於對糖皮質激素和/或細胞毒性藥物反應差及不反應的SLE患者。CsA療效及耐受性較好，但長期效果及安全性尚不清楚。CsA初始劑量為3～3.5mg/kg·d，分12次口服;最大劑量為5mg/kg·d。
FK506的作用機制類似於CsA，具有強大的免疫抑制作用，且毒副作用較CsA更小。
藥物治療主要就是激素和免疫製劑，要根據不同病情進行選擇。如果是有內臟受累的時候首選激素治療，病情很輕比如只有關節炎、皮疹的患者，可以選用非載類抗 炎藥等對症治療。如果有內臟受累，如腎臟受累出現尿蛋白，這時候應該首選激素治療。激素類藥物應該慎用，用好了起效很快，一些危重的病人用了以後效果明 顯。同時加上免疫製劑可以控制病情發展。但是每個人的用藥是不一樣的，選擇哪一種用藥要根據當時情況來進行選擇。