DNA免疫吸附柱治療系統性紅斑狼瘡是將患者的血液通過含有DNA免疫配體的吸附器，特異性吸附患者血液中抗核抗體、抗雙鏈DNA抗體等大分子致病物質，血液經過淨化後回輸到患者體內，從而達到治療系統性紅斑狼瘡的目的。DNA免疫吸附柱治療系統性紅斑狼瘡可出現以下不良反應。
1、上機反應：患者在接受DNA免疫吸附柱治療45分鐘內最容易出現臉紅、心悸、心慌、胸悶等上機反應。為預防上機反應，治療時血流速度不宜過快，儘量保持在100～150ml/分鐘。
2、過敏反應：治療所採用的吸附柱、吸附液、封裝物等均可能引起過敏反應。若患者出現過敏反應，應及時給予激素、抗組胺藥、鈣劑等藥物治療，並讓患者吸氧，防止出現低氧血症。
3、出血：在進行DNA免疫吸附柱治療的時候，會用到抗凝藥物，使患者有潛在的出血傾向。為預防出血，術後可用魚精蛋白中和肝素的抗凝作用。患者的穿刺點應用紗布加壓壓迫，防止從穿刺部位滲血。
4、凝血或栓塞：吸附器能吸附少量肝素，因此肝素的用量要大於血液透析;若血液流速過慢，易引起凝血，所以要保證血流量充足;不要敲打灌流機，防止灌流機內微粒脫落進入血液。