早產兒器官發育不成熟，對外界環境適應能力差，易發生各種併發症。
一、新生兒呼吸窘迫綜合征：
由肺表面活性物質合成不足所致，本病主要見於早產兒及剖宮產兒，尤多見於33周以下。
二、頻發性呼吸暫停：
約70%極低出生體重兒可發生呼吸暫停，每日呼吸暫停可多達40多次，呼吸暫停既可為原發性，亦可繼發於低體溫、發熱、缺氧、酸中毒、低血糖、低血鈣、高膽紅素血症等，呼吸暫停常於孕齡34-36周才消失。
三、慢性肺損傷：
早產兒由於氣道及肺泡發育不成熟，易因氣壓傷、吸氧中毒或動脈導管開放等而損傷，引發支氣管肺發育不良，Wilkson-Mikity綜合征及早產兒慢性肺功能不全。
四、腦損傷：
約70%的早產兒發生腦室內出血或腦室周圍白質軟化，體重五、硬腫症：
早產兒體溫調節功能差，體表面積相對較大，皮膚較薄，血管豐富，易於散熱，而棕色脂肪的量又少等因素易致低體溫而發生皮膚硬腫。
六、感染：
由於細胞及體液免疫功能的不成熟，來自母體的抗體不足，皮膚屏障功能不成熟，頻繁的器械操作等，致早產兒易發生感染性肺炎，敗血症及壞死性小腸結腸炎。
七、高膽紅素血症：
早產兒容易發生高膽紅素血症和膽紅素腦病，它與低蛋白血症、缺氧、酸中毒、低血糖、感染及膽紅素腸肝迴圈等有關，主要由於肝臟缺少葡萄糖醛醯轉移酶，未能把游離膽紅素轉變為結合膽紅素之故。