肛瘺是肛腸病中變化最多治療難度最大的疾病，手術是目前唯一的有效治療手段，但許多患者在術後又復發了，到底是什麼原因造成的？復發不僅是治療失敗，由於瘺管的完整性遭破壞和手術留下的瘢痕，將給再次手術增加較大難度，也將對肛門的括約功能造成嚴重影響。因此，分析失敗原因，儘量爭取一次手術成功有極其重要意義。
1.內口定位錯誤
內口是肛瘺的感染源，腸腔的致病菌正是從內口進入肛周才引起肛周膿腫和肛瘺的，一般位於肛門內3-4cm處的直腸和肛管交界處。外口是感染病灶的潰破口，多數在肛緣外，也有少數在肛內。肛瘺手術的成敗最重要的因素在於準確定位內口和充分切開內口。
肛瘺外口多是顯性的，內口則90%以上是隱性的。臨床上尋找內口的最主要方法是從瘺管內探查或指診觸摸。由於很多肛瘺遷延日久，瘺管內反復感染形成粘連而堵塞不通，就無法通過探查和造影的方法來尋找。對於瘺管彎曲、多外口的複雜瘺同樣也無法探查。如果沒有一定的臨床經驗，沒有掌握肛瘺內口的形成規律，往往在術中只切開了部分瘺管，真正的內口仍存，導致術後復發。
2.掛線術盲目人為製造內口
掛線術是中醫傳統療法，也是目前臨床治療肛瘺採用的最主要方法，其原理是利用膠線的彈力收縮，慢性勒割管壁，敞開瘺管而起到治療作用。但我們發現掛線術不僅存在痛苦大、癒合時間長、對肛門括約肌損傷重等缺點外，還有相當高的復發率。
無論是早期的瘺管壁全部掛線還是現在的切掛，其方法都是將膠（絲）線從肛瘺外口穿入瘺管，然後從內口拉出，收緊線的兩端並結紮在一起。如果瘺管暢通，線開從內口準確拉出，瘺管壁被完整打開而獲得治癒，但如果瘺管中間粘連或內口閉合，在穿線過程中就很有可能穿出管壁進入瘺管外組織，然後從人為的穿破口出來，這樣，部分關鍵的瘺管和內口就被遺漏而沒有打開，從而造成手術失敗，術後復發。