克羅恩疾病的引發經常讓患者比較痛苦，目前針對這種疾病的治療一般以控制病情為主要治療目的，因此要注意對這種疾病進行有效的預防。那麼，克羅恩病為什麼會發作呢?
遺傳因素：很多克羅恩疾病患者的引發大部分都與遺傳有關，根據患者的具體情況來看，研究發現單卵發育的孿生子之間患Crohn病的一致性比率明顯升高，為67%，而雙合子的孿生子，其一致性比率僅為8%。同時發現Crohn病患者與配偶之間表現為不一致性，且與普通人群無差別。以上表明本病有家族聚集性。
易感性的改變：通常這也是造成患者疾病引發的重要因素，不能忽視這一點，Crohn病的發生可能與機體對腸道內多種抗原刺激的免疫應答反應異常有關。越來越多的證據表明，Crohn病患者固有膜的T細胞啟動增強，包括T細胞啟動的表面標誌表達增加，T細胞細胞活素生成增加，以及細胞毒T細胞功能增加。這種T細胞啟動的增加導致了效應細胞的聚集。並隨後合成破壞性物質，由此造成Crohn病腸損傷。
感染因素：往往感染因素是造成很多疾病引發的重要因素，克羅恩疾病也是如此，早年因Crohn病的病理表現與非鈣化的結核病變相似，曾懷疑本病由結核桿菌引起，但用各種方法均未能分離出此病菌。從Crohn病切除的腸段和腸系膜淋巴結中培養出Kansasii分枝桿菌或與結核桿菌類似的分枝桿菌的報導。研究發現，這些分枝桿菌接種於小鼠腹腔中可在其肝、脾中發生肉芽腫並出現抗酸桿菌。再把這些抗酸桿菌給乳羊口服，數月後羊的回腸末端可發生非乾酪性肉芽腫。分枝桿菌可能是Crohn病的病因。