膽汁反流性胃炎能夠造成消化道吸收功能紊亂,從而出現胃部本身病變及營養代謝、植物神經功能調節、內分泌激素釋放水準、生長發育機能以及整體免疫機能的全身影響,成為繼發其它疾病的重要潛在因素。嚴重者會直接影響患者的消化系統。
導致食管狹窄。由於食管炎引起繼發性食管痙攣,一般呈現間歇性吞咽困難。如果一直持續性吞咽困難則就可能會導致食管狹窄。食道一狹窄，食入的量也就少了。
導致慢性喉炎。當患者有膽汁返流性胃炎時,一些患者精神緊張,致輕度缺鐵性貧血,潰瘍偶引起大量出血。還有重症反流性食管炎因反流物吸入,可導致慢性喉炎、聲帶嘶啞、哮喘發作或吸入性肺炎等。所以這類患者要特別注意。
引發胃癌。膽汁反流可以導致上消化道炎症、潰瘍,也就是說長期膽汁反流可以導致食管炎、糜爛性、增生性、活動性炎症、胃潰瘍、甚至促使發生胃癌。與上消化道炎症、潰瘍、腫瘤的發生都有重要關係。