繼發性三叉神經痛症狀不典型，除了要做常規檢查外，還需做相應的輔助檢查以便明確病因，對症治療。
顱腦CT、MRI檢查
通過這兩項檢查，可以發現三叉神經痛患者是否存在顱腦腫瘤、炎症等。炎症是繼發性三叉神經痛的常見病因，腦橋小腦角腫瘤在腫瘤中占多數，其中膽脂腫瘤占首位，炎症是指腦橋小腦角的蛛網膜炎。
磁共振血管成像技術檢查
磁共振血管成像技術已經成為評估血管性疾病的一種有效檢查方法。在檢查三叉神經痛時，可以分析三叉神經痛與三叉神經血管壓迫之間的關係，以便制定合理的治療方案，更有效地進行微血管減壓術，進一步提高此類三叉神經痛患者的治癒率。
血糖或葡萄糖耐量實驗檢查
同時患有糖尿病的三叉神經痛患者還需做血糖或葡萄糖耐量實驗，用以排除三叉神經痛患者的糖尿病性神經病變。
腦幹三叉神經誘發電位（BTEP）檢查
腦幹三叉神經誘發電位檢查是評價三叉神經傳導功能的有效電生理方法。三叉神經病變者BTEP檢查有電位異常變化，且患者的周圍神經病變和中樞神經病變異常，BTEP表現各異，所以這種檢查對三叉神經痛的診斷有所幫助。