睾丸炎需與以下幾種疾病相鑒別：
1.睾丸腫瘤 初期為睾丸的無痛性腫塊，逐漸增大，出現墜脹疼痛，腫塊質地堅硬，表面凹凸不平，腫塊增長較迅速。多見於中老年男性，血常規化驗及B超檢查有助於與急慢性子癰鑒別。
2.附睾結核 可有其他部位的結核病史，或結核病接觸史，患側陰囊酸脹隱痛，附睾及輸精管呈串珠狀增粗，病久附睾與陰囊皮膚粘連，形成寒性膿腫，潰流稀薄膿液或豆腐渣樣物質，並形成竇道，經久難愈.全身可見潮熱、盜汗、疲乏無力，膿液塗片可查到結核桿菌口。
3.急性睾丸扭轉 多見於青少年，有劇烈運動史，突發性睾丸腫脹疼痛，精索靜脈增粗、縮短，無全身惡寒發熱等症，外周血白細胞顯著增高。
4.嵌頓性腹股溝斜疝 有腹股溝斜疝病史，疝內容物滑人陰囊後不能還納，出現陰囊腫大脹痛甚至絞痛，但睾丸附睾不腫大，無壓痛。超聲波檢查及血常規化驗可資鑒別。
5.睾丸鞘膜積液 一側睾丸逐漸腫大，不紅不熱不痛或輕微墜脹，為水液聚積於睾丸鞘膜腔內所致。血常規檢查白細胞總數不高，透光試驗陽性。
6.陰囊炎 病位在陰囊而不在睾丸，陰囊皮膚紅腫熱痛，而睾丸或附睾不腫大。