精子生成障礙是引起無精症的一個重要原因，也是無精症引起男性不育的原因，精子生成障礙的疾病因素主要有：遺傳性疾病、先天性睾丸異常、睾丸本身病變、內分泌疾病、嚴重全身性疾病和營養不良等。
遺傳性疾病
常染色體或性染色體異常可影響睾丸內精子的生成，如克氏（Klinefelter）綜合征、睾丸女性化綜合征等。遺傳性疾病影響精子發育，造成少精症或無精症，使患者喪失生育能力。
先天性睾丸異常
睾丸發育異常或睾丸位置異常均能使精子生成障礙。睾丸發育異常如無睾畸形、隱睾疾、睾丸發育不全；睾丸位置異常如睾丸外傷致移位、輸精管動脈外傷、睾丸扭轉等都可導致精子生成障礙，引起無精症的發生。
睾丸本身病變
睾丸外傷、炎症、扭轉、睾丸血管病變、流行性腮腺炎合併睾丸炎等所致的睾丸萎縮均可破壞精子生成環境，致精子生成障礙，引發無精症。
內分泌疾病
垂體功能亢進或低下、垂體腫瘤、腎上腺功能亢進或低下、甲亢或甲減均可影響精子生成而造成無精子症。
嚴重全身性疾病及營養不良
嚴重全身性疾病和營養不良都可導致睾丸發育異常，引起男性無精症。