一般情況下，甲狀腺功能亢進症比較容易確診，大部分在診堅持正規治療即可，當出現以下情況時必須住院治療。
甲狀腺危象：當甲亢患者出現高熱、心動過速、嘔吐、腹瀉、大汗淋漓、煩躁甚至昏迷時，應考慮到甲狀腺危象的可能，這是甲亢患者最危險的併發症，如不及時診治，有生命危險。
甲狀腺功能亢進症合併浸潤性突眼的患者。
甲狀腺功能亢進症合併嚴重肝功能異常、肝損害的患者。
甲狀腺功能亢進症合併白細胞減少的患者，當患者外周血的白細胞少於4.0×109/L時，特別是中性粒細胞少於1.5×109/L時，必須立即住院，否則極易引起各種嚴重的感染;在服用抗甲狀腺藥物期間，白細胞發生了上述改變時，也應該及時住院治療。
合併甲亢性心臟病的患者，尤其是伴有嚴重的心律失常、心臟擴大、心力衰竭時。
合併甲亢性肌病，尤其是週期性麻痹發作時。
甲狀腺功能亢進症合併糖尿病，血糖控制不好的患者。
甲狀腺功能亢進症有頸前新液性水腫的患者。
甲狀腺功能亢進症需要手術治療的患者，應住院進行術前準備，妥當後進行手術。
進行放射性碘治療後，短暫隔離觀察時需要住院。
診斷不明確，需要特殊檢查，如甲狀腺穿刺、甲狀腺功能試驗的患者。
口服藥物治療，出現嚴重過敏的患者。
需要特殊治療如甲狀腺動脈栓塞術的患者。
甲狀腺功能亢進症有嚴重精神症狀的患者。
甲狀腺功能亢進症合併妊娠，應在分娩前提前住院。
甲狀腺功能亢進症合併早期妊娠，防止流產時也應該住院。