兒童甲亢主要採用抗甲狀腺藥物治療，常需服藥1.5～3年，停藥後復發率較高。而成人甲亢治療的基本方法有抗甲狀腺藥物治療、放射性碘治療和甲狀腺手術治療3種。
（1）兒童甲亢一般不採用手術治療，因手術後復發率較高，也容易造成甲減、喉返神經損傷和甲狀旁腺功能減退。而當1～2個療程的抗甲狀腺藥物治療無效或復發者，對藥物過敏或不能堅持服藥著，方可考慮手術治療。
（2）兒童甲亢不宜採用放射性碘治療，首先、兒童對放射線較成人敏感，疑有致甲狀腺癌的可能，故不宜用放射性碘治療。其次甲亢兒童用放射性碘治療後甲減的發生率也高，有報導達46%，而甲減對於兒童的生長發育甚為不利