再生障礙性貧血患者在進行造血幹細胞移植前需要進行術前準備，患者一般需要提前進入無菌層流病房，並進行預處理等環節。移植捐獻者的幹細胞提取後應儘快移植給再障患者，可是如果由於某些原因導致提取的造血幹細胞不能立即移植，如捐獻者和受者不在一個地區，受者尚未達到移植的條件等，造血幹細胞就需要暫時保存。
再障患者的移植如果能在1~2天內完成，造血幹細胞就不需冷凍，可採取非冷凍的保存方式。非冷凍保存包括4℃冰箱保存和CO2孵箱保存。
4℃冰箱保存將經過肝素抗凝的含有1/3組織培養液的骨髓直接放入4℃冰箱中保存，一般經過分離的全骨髓在4℃冰箱保存4天，造血幹/祖細胞集落回收率可達到50%，保存7天則回收率下降到20%，而在存活的這些細胞中，早期造血幹細胞的比例增高。總的來看，細胞在4℃保存24小時其功能基本是穩定的，保存3~4天后一般下降為原來的50%~80%，因此目前在臨床應用4℃保存骨髓對患者進行骨髓移植時，一般均選擇在24~72小時以內將骨髓回輸。
CO2孵箱保存是將造血幹細胞分離出來，加入適當的營養體系後放入孵箱中培養，根據培養體系的不同，細胞可以保存不同的時間，在某些培養體系中，幹細胞甚至能保存數月。同時該方法不僅保存了造血幹細胞，而且使其數量大量擴增。